水電改造
由於面積較大，天然水電改造的工程量也有所增加，因此質量無法得到較好的控制。水電改造本來就是別墅隱蔽裝修的難點。在獨棟別墅的建設過程中，或多或少存在水電項目不合理、水電後期修改、水電施工質量存在隱患等問題。
空間化
因為布局選擇的空間太大，雖然空間充足，但也造成了設計時空間規劃的諸多困難。比如主人把規劃好的茶室改成大書房，很容易造成這個功能齊全的書房基本閑置，之前想要的那種閑適感根本沒有找到。
地下防潮
大部分獨棟別墅都有地下室，用作停車場、棋牌室、臺球室等。，而地下室的問題在於地下室防潮，這也是如今別墅裝修中的致命弱點。所以不僅要在施工上細心，更要在設計上體貼入微。
別墅花園
現在很多別墅的裝修中，別墅業主對園林設計的滿意度普遍反映出別墅園林設計不專業，服務不夠精細化。在設計方面，室內設計師做不好園林設計，園林公司在裝修方面也不是很專業，所以別墅園林設計成了別墅裝修設計中的灰色地帶。