1.地點:三亞海關位於海南省三亞市友誼路，三亞機場海關位於海南省三亞市鹿城大道三亞保稅物流中心。
2.轄區不同:三亞海關隸屬海口海關，業務管轄範圍覆蓋海南省所有市縣。三亞機場海關業務管轄範圍包括三亞鳳凰國際機場和三亞保稅物流中心。