海門位於江蘇省東南部，東臨黃海，南臨長江，素有“江海門戶”之稱。與上海隔江相望，素有“北上廣”之稱。該市位於北緯31° 46 '-32° 09 '，東經121° 04 '-121° 32 '。境內地勢平坦，溝渠縱橫，地表平均海拔4.96米(以廢棄的黃河為基準)。地勢西北略高，東南較低。西部最高點海拔5.2米，東部最低點海拔2.5米。南北斷面呈孤形，兩端低中間高。
海門，位於長江入海口，素有“江海門戶”之稱。黃海以東的海門與日本、韓國隔海相望，距離長崎、釜山等國際港口僅400海裏；長江以南，與上海直線距離僅60公裏，全市土地面積1148.77平方公裏。