鄭錚十六年(1356)60歲，張士誠據蘇招安。他與卞、部將張士誠交好，後遷居江陰，在祝塘鎮任教。71歲或72歲遷居興化，遷居白菊場、石家橋。朱元璋多次拒絕征收；最後住在淮安，享年74歲。
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張士誠起兵反元時，施耐庵參與了他的軍事活動。張據蘇後，史在他的庇護下參與策劃，並與其部將卞關系密切。後來的施耐庵、盧淵、劉良、陳濟等。大失所望，紛紛離開，因為張貪圖享樂和缺乏建議。
在送別陸和劉翔時，他作了壹首套曲《新水盡秋江別》，以表達自己慷慨的哀思。不久，張士誠駕崩，國破家亡。石遊遍天下，漫遊山東、河南等地。他與交好，曾受鄆城縣教，後隨老師住在江陰徐氏家族早期。
後來他又回到自己的老白小馬身邊，無法隱居，覺得時局在走下坡路。他以寫水滸為寄托，和徒弟羅貫中壹起寫了《三國演義》和《三穗平遙傳說》。他也擅長詩歌，但流傳甚少。除套曲《秋江送別》外，還有其他流傳下來的詩歌，如顧體詩、劉良詩等。
施耐庵躲在淮安躲避明朝征兵，病死，就地安葬，享年75歲。乃安去世幾十年後，孫文玉家人丁興旺。明嘉靖十九年(1540)，高茹《百川錄》載:“忠義水滸100卷。錢塘本。
羅貫中編輯。”嘉靖四十五年，郎英在《七修抄本》中說:“此書為錢塘施耐庵之書。寫完《水滸傳》沒幾年，施耐庵就病死了。水滸傳代代相傳！
參考資料:
百度百科-施耐庵