馬圖騰崇拜源於龍圖騰崇拜，因為先民對馬的認識與龍圖騰崇拜意識密切相關。關於負面圖的“龍馬”，要麽認為這匹馬具有龍的特征，要麽就把它與龍相提並論。無論哪種方式，馬和龍都有壹種持續的關系。
馬的奔馳跳躍輕盈、健康、快速，類似於人們想象中的龍翺翔的造型。所以，自古以來，把馬比作龍，或者直接把馬中的佼佼者稱為龍，是很常見的。《李周下關任薰》雲:“馬八尺以上為龍，七尺以上為馬，六尺以上為馬。”可見，在古代，八尺以上的好馬被稱為龍。《禮記·月令》記載，皇帝去郊祀時有“驅黑龍”之語，“黑龍”為良馬之名。所以後世每遇良馬，便稱之為“龍兒”、“象龍”、“龍駒”、“龍種”或“龍馬”。
古代人之所以把馬提到與龍的圖騰崇拜同等的高度，是因為馬在人類生活中占有非常重要的地位。農耕民族種田、駕車、騎馬需要馬，遊牧民族放牧需要馬，人類在戰爭中為了生存空間和政治利益需要馬。古代擁有馬匹是財富和權力的象征，是國力強盛的重要因素。《後漢書·馬援傳》記載，馬援鑄造了壹匹青銅馬，獻給朝廷。桌上章曰:“夫能行如天上龍，地上如馬。馬乃兵之本，國之大用也。”他對馬的作用有深刻的見解。
而且古代的人認為馬比其他動物更有靈性，有時能救人於危難，能分辨善惡，表現出對人類理性的忠誠和效忠。正史和野史的筆記中有很多關於馬救星和馬報老板的故事。幹寶《搜神記》中的“馬蠶”故事，是以農耕編織為主要生產方式和生活方式的民族文化心態的典型反映。馬代表農耕，蠶代表紡織，馬變成蠶反映了農耕與紡織的密切關系，所以人們所崇拜的蠶神也被稱為“馬頭娘”或“馬明菩薩”。《李周夏關張之》有壹句“原蠶禁”，前人註“若以天文考，午馬為絲蠶，則馬與蠶皆屬午。”辰為龍，馬為龍等等，蠶為龍之精，所以馬蠶也富於辰。“這裏明確指出了蠶、馬、龍的關系，從中可以看出馬圖騰崇拜具有非常豐富的文化內涵。
河圖的起源到底是龍還是馬，龍還是馬是龍還是馬，這些糾結的問題正是中國古代龍圖騰崇拜和馬圖騰崇拜相互聯系、相互交織的文化現象的反映。河圖既叫“龍圖”，又叫“馬圖”，本來就是中國龍文化的產物。