崇禎三年(1630)，左良玉復職後，宰相馬士龍讓左良玉跟隨遊擊將軍曹文詔支援玉田、馮潤，在虹橋、大千山、遵化等地與清軍作戰。戰爭結束後，他被曹文詔提升了軍銜。李昌平督侍郎侯堯。
崇禎四年(1631)七月，由於此前高第撤回寧晉防線，尤屯、大淩河等城市被毀，孫承宗派人重建，但不久清軍突然前來圍攻。連長尤士偉因為守墓不能去，就推薦左良玉代他帶兵。後來，侯洵選他為副將，率隊在嵩山、興山腳下與後金作戰，功勞第壹。崇禎六年(1633)正月，農民軍入侵西州，打下陽城。左良玉在歙縣西貝打敗了它。二月，左良玉的軍隊在武安與亂兵作戰，大敗而歸。尚茂被革職，由太常邵青袁默接任。三月，農民軍士兵再次進入河內，左良玉從輝縣派兵驅逐。敵人逃到修武，打死了遊擊將軍。越是忠心耿耿，越是追著加入的參謀陶希謙，陶希謙從馬上摔下來死了。左良玉在萬山驛鎮壓農民軍，直到追到柳樹下才振振有詞地打敗他們，活捉了幾個農民軍的頭目。農民軍隨後逃往西部。河南的兵只有7000人。幾經與賊戰，傷亡都差不多了。左良玉在昌平領兵二千余人，幾經征戰。雖然做出了成績，但權力很薄。總兵鄧貴剛在萊州立了大功。朝廷命他帶領川兵，和司馬鳳儀的部隊壹起從四川石角出發，立即前往左良玉，和左良玉壹起殺農民軍。不久，馬鳳儀因為孤軍奮戰，在侯家莊全軍覆沒。
這時候農民軍已經很強大了，兵力遍布三晉、北京和黃河以北的廣大地區。曹文詔、貝利、艾萬年、唐九洲、鄧貴、左良玉等將領先後與農民軍作戰，互有勝負。左良玉、鄧貴負責河南戰爭，在關村、沁河、青華、萬山等地多次擊潰農民軍。左良玉在武安八德再次阻擊他們，打死俘虜大量農民軍。崇禎皇帝朱由檢，任命倪崇、王璞為總兵，率領六千大軍從京營到豫州，讓宦官楊進朝、盧九德督梁羽生等人的軍隊。員工的醫生李姬珍說:“良玉和貝利親身經歷了許多戰鬥，但他們的地位不如倪沖和王璞。我怕他們聽了會灰心。”所以讓左良玉、貝利做大都督、助理總兵，大致和倪崇、王普差不多。北京營的部隊趕到後，聯合進攻農民軍，幾次立功。左良玉在濟源、河內打敗土匪，在永寧、青山嶺、銀洞溝打敗。然後從葉縣追到小武當山，打死了很多農民軍士兵。但是，將軍們卻因為宦官督軍而不高興。
同年冬，逃往西部的農民軍掉頭打東。左良玉、唐九州在前，京營大軍在後。農民軍很尷尬，明軍在劉全和老虎村大敗。農民軍將領張妙壽、何雙全等。36名士兵謊稱向都督特使常道禮求情，並通過監軍金揚向朱由檢報告此事。將軍們等待著朝廷的命令，卻又不敢開戰。天氣寒冷，黃河上結了厚厚的壹層冰，農民軍從澠池跨過黃河。太守袁默，引左良玉、唐九洲、貝利、鄧貴等軍，在對岸接應。農民軍於是逃到了盧氏山。之後從雲陽、襄陽入川，繞道進攻秦隴地區。還在川鄂壹帶流竄，以至於中原在機會來侵河南的時候更加殘破，三晉、北京周邊十年不被盜賊侵擾。崇禎八年(1635)正月，河南農民侵潁州，毀鳳陽皇陵。當敵人打下陸毅、柘城、寧陵、通許時，守徐州的左良玉未能前來救援。四月，杜詩洪承疇駐守汝州，命令將領們阻擋農民軍。遊士威鎮守洛南，控制盧氏、永寧，鄧貴、遊翟文、張應昌、許在湖廣阻擊農民軍。由於吳村、瓦屋是內鄉、淅川的要沖，左良玉、唐九洲奉命率領五千人把守。
不久，鄧貴因兵變而死，而曹文詔在陜西征服農民軍，在鎮寧戰敗。農民軍比較厲害，於是越過盧氏，直奔永寧。太守袁默被捕不走，就命梁羽帶著老家的陳誌邦、馬壹起去幫助呂氏。八月在鹽城打敗農民軍。9月，左良玉跟隨敵人來到佳縣神神山。農民軍軍營綿延數十裏，輪番休整、戰鬥，讓明軍疲憊不堪。左良玉撤軍，停止戰鬥。農民軍再次進攻密縣，左良玉在敵人離開前救出了佳縣。10月，左良玉到達靈寶，與遼東連長祖寬會師，殲滅澗口、焦村農民軍。焦村屬於朱陽關領地。十壹月，李自成出諸陽關，張久占靈寶，奇遇王與之會師。
左良玉、祖寬在靈寶截擊，無力抵抗敵軍，陜州失陷。農民軍東進攻打洛陽，左良玉、祖寬跟隨巡撫陳必謙救援洛陽，農民軍因此撤退。、李自成投偃師、珙縣，張投嵩縣、汝州。左良玉從洛陽出發追擊、李自成，祖寬屏分兵數路攻打張，解救汝州。正巧宰相盧象升從湖廣來，帶著祖寬在汝州西部打敗了農民軍，就命令他寵信的將軍們帶領他們去打敗益陽黃澗口的農民軍。
崇禎九年(1636)二月，農民軍在登封高塍鎮潰敗，逃至石羊關，與益陽、嵩縣敵軍會師。前連長九州從嵩縣深入，與左良玉並肩作戰，鎮壓農民軍。左良玉半路出逃，唐九州追擊四十裏。因為他的孤立，他被打敗了，死了。而左良玉卻將這壹服務作為喜訊呈獻給了朝廷。五月，派祖寬、李鎮隨陜西巡撫洪承疇西征。左良玉的軍隊最強，大部分都是中州人，所以他壹個人在河南呆了很久。因為他狂妄自大，很少聽他的話，所以孔道光代替他的將軍趙主駐守靈寶保衛洛溪；左良玉、羅岱駐守益陽、永城，防守羅東。七月，左良玉大軍抵開封，從登封唐莊深入其中。從淩晨到下午，農民軍支撐不住，向西逃竄。陳永福剛剛在唐河打敗敵人，農民軍就到了田家英，左良玉渡河進攻，打死俘虜了很多人。九月，巡撫楊彈劾左良玉避敵，朝廷命其立功贖罪。
崇禎十年(1637)正月，農民軍將軍歸降，與曹操及沿江突圍的各部勢力會師，安慶傳來警報。法院判令左良玉從中期起前往救助。在去左良玉的路上，南陽的土匪田陽、侯玉民、郭三海被剿滅，急忙趕到六安迎擊農民軍。羅岱和道行會打勝仗，壹次又壹次的贏。農民軍逃到霍山和潛山。此時，麻鞋、劉亮佐也在桐城、瀘州、六安等地多次擊潰農民軍，滁州、賀州等地的農民軍也紛紛西逃，江北危機稍有減弱。對此，巡撫張國威三次發出檄文，要求左良玉進山搜查，但左良玉沒有回應，反而派士兵在當地掠奪婦女。在舒城住了壹個多月，豫軍的宦官催他北上。這時候農民軍已經掠奪夠了，進入山區。之後西川失陷，左良玉坐回，不去救援。因其在六安克敵有功，聖旨曾令其認罪立功，現已恢復官職。農民軍東攻六合，攻占天長。兵分幾路占領瓜州和壹真，為盱眙打下了基礎。左良玉堅決不肯前去救援，反而是中州士紳聯名上書挽留自己。朱由檢知道這是左良玉自己的意願，他無法改變他的意誌。十月，宰相熊文燦到安慶，兵部令左良玉的部隊歸他指揮。左良玉看不起熊文燦，不肯聽他的。
崇禎十壹年(1638)，左良玉和連長陳洪範在鄖西大敗農民軍。張想以朝廷的名義進攻南陽，就駐紮在南關。左良玉及時趕到，當他起了疑心，他叫他們來，張鐘弦逃走了。左良玉追上去，射了兩箭，打在他肩上，又揮刀砍去，張正在流血。他的手下被及時救出，避免了死亡，於是逃到了谷城。很快，他們要求投降。左良玉知道他是假裝投降，試圖要求對他進行攻擊，但熊文燦不允許。九月，熊文燦進攻雲陽、襄陽農民軍，俘虜兩千頭。十二月，河南巡撫常道裏派左良玉到陜州。農民軍趁盧氏駐軍空虛，逃往內鄉、淅川。這個月，徐州發生兵變。左良玉家人被安置在徐州，兵變中被殺。
崇禎十三年(1640)，監軍楊嗣昌推薦左良玉為“將軍，兵亦可用”。後來在川陜交界的平利地區，張會師，張大敗，忠臣妻妾被捕，農民軍領軍人物被殺，左良玉加太子護少。楊嗣昌雖然拜左良玉為平賊將軍，但總覺得他太驕傲而不被利用。除了督察對左良玉的約束，還暗中許諾他龍仁可以代替左良玉。正當何急欲撤換左良玉時，左良玉在瑪瑙山大敗農民軍。楊嗣昌對何說:這個任命以後再談。他龍仁為此懷恨在心。並把這件事告訴了左良玉。左良玉懷恨在心。川陜壹戰，楊嗣昌命令左良玉攔截農民軍，左良玉袖手旁觀，而楊嗣昌探望左良玉，左良玉仍不予理會。由於左良玉無法觀戰，張從容出川攻襄陽，農民軍大獲全勝。楊嗣昌沒進湯就暴怒而死。崇禎十四年(1641)，左良玉因立功被貶贖。
崇禎十五年(1642)，侯洵賞賜左良玉部下五十萬。左良玉與李自成在朱仙鎮交戰，左良玉大敗，退守襄陽。開封再戰，左良玉不敢戰。李自成隨後攻打襄陽，左良玉退兵到武昌，左良玉向楚王要兵力和工錢，但都沒有得到補給，於是掠奪武昌，包括糧鹽船。我們到了九江後，征召了20萬士兵保護自己。張攻克武昌後，朝廷下令出兵赴張，張大敗，收復漢陽。張入蜀後，派兵收復武昌。崇禎十七年(1644)三月，朝廷下詔左良玉為“寧南伯”，賜其子左孟庚賊將之璽，並許諾建成後讓父子世世代代鎮守武昌。又命左路過時催他發兵打仗，於是左良玉按月擬定了發兵計劃，交了上去。他遞交奏章後沒有得到朝廷的回復，卻聽說北京被李自成攻陷了。左良玉手下的將領們都慌了，因為江南設斧王朱有勇，要他領兵東進。左良玉痛哭失聲，發誓不讓他們去東方。上尉馬石秀說:“誰不聽左貢的命令，想往東走，我就殺了誰！”並在大船上架起大炮切斷長江航線，大家才平靜下來。
斧王繼位後，提拔左良玉為侯，他的壹個兒子被任命為錦衣衛。與他壹起被任命為官員的四個城鎮，即黃德功，高傑，和魏，他們都被命名為世襲職位的後代。左良玉被專門委以長江上遊的事務，不久就被封為太傅太子。當時李自成在山海關大敗，左良玉利用這個機會收復了鄂西的荊州、德安、承天。湖廣總督何騰蛟、湖廣總督袁繼賢居住在江西。他們都與左良玉非常友好，弘光法院利用這壹地區作為屏障。左良玉的為官，曾經得益於侯耀的推薦。侯耀方祖籍林東。馬士英、阮大鋮上臺後，擔心林東黨員依靠左良玉為難自己，於是假惺惺地與左良玉交好，暗中嫉妒他，並修建了扳機城作為防禦西方的屏障。左良玉嘆了口氣說:“現在西方有什麽好防的？大概是為了防備我吧！”！“在朝廷各種事情日益惡化的時候，監軍黃澍利用梁羽生的力量，當面頂撞馬士英和阮大鋮。黃澍回來後，朝廷派了壹個安全官員去逮捕黃澍，而左良玉拒絕交出黃澍。於是黃澍和其他壹些將軍要求良玉每天派軍隊去清除皇帝身邊的壞人。左良玉猶豫了壹下，沒有同意。不久，北方來找太子的事件發生了。黃澍借此機會激起大家的怨恨以報復他的仇恨，並召集36名營級將領與他結盟。
左良玉於是下定決心造反，並發出了反對馬士英的檄文。從漢口到周琦，排列了200多裏長的戰船，順流而下。當時，左良玉的病情非常嚴重。到了九江後，他邀請巡撫袁繼先上船，並從袖子裏拿出壹份密信，說是皇太子送來的，借此劫持當地將領與他結盟。在閆妍拒絕了他之後。梁羽生的部將郝仲忠秘密進入九江城，放火燒城，然後離開。左良玉看著滿城的大火說:“對不起元恭！”當場吐了幾升血，當晚就死了。
卒年為清順治二年四月(1645)。將軍們不會發喪，* * *推舉他的兒子左夢庚為軍隊首領。七日，大軍東進，朝廷命黃德恭渡河防守，殲滅叛軍。左夢庚帶領其余將士投降清朝。