羅湖區、福田區、南山區、鹽田區位於經濟特區內,寶安區、龍崗區地處經濟特區外。羅湖區
位於經濟特區東部，市金融、商貿中心，網絡服務基地。東起蓮塘，西至紅嶺路，與福田區接壤；南臨羅湖橋與香港毗鄰；北到特區管理線公路，與龍崗區布吉鎮、沙灣村相連。全區總面積78.89平方公裏，下轄8個街道辦事處，131個居委會。福田區
位於經濟特區中心地帶，是深圳市委、市政府所在地，市行政、文化、信息、國際展覽和商務中心。東起紅嶺路與羅湖區相毗鄰，西至華僑城與南山區接壤，北靠筆架山、蓮花山與寶安區相連，南瀕深圳河、深圳灣與香港元朗區隔水相望。全區總面積78.8平方公裏，下轄7個街道辦事處,116個居委會。南山區
位於經濟特區西部，市高新技術產業基地、高等教育基地和西部物流、旅遊中心。東臨深圳灣，與福田區接壤；西瀕珠江口，與寶安區毗連；北靠羊臺山，與寶安區石巖鎮相鄰；南至蛇口灣、大小鏟島和伶仃洋，與香港元朗隔海相望。全區總面積為150.79平方公裏，下轄7個街道辦事處和招商局蛇口工業區，111個居委會。寶安區
位於市區西部，經濟特區管理線以北。市高新技術產業、先進工業、加工貿易、"三高"創匯農業和生態旅遊基地。北至羅田水庫，西至東寶河與東莞市交界，東至南頭經濟特區檢查站，西南臨珠江口及交椅灣養蠔保護區，深圳機場在該區轄區內。區政府駐新安鎮（原寶安縣城）。全區總面積733平方公裏，轄8個鎮及新安、光明2個街道辦事處，設34個居民委員會和126個村民委員會。 龍崗區
位於市區東部，經濟特區管理線以北。市高新技術產品出口加工基地、物流配送基地和海濱度假旅遊基地。東至大亞灣,南臨大鵬灣,西與寶安區相鄰,北與東莞、惠州市交界。大亞灣、嶺澳核電站在轄區內。區政府駐龍崗鎮。全區總面積940.9平方公裏，轄10個鎮，設25個居民委員會和91個村民委員會。鹽田區
位於經濟特區東部,背仔角經濟特區管理線以南,西傍梧桐山,東臨大鵬灣。中國第二大集裝箱深水港--鹽田港在其轄區內，同時該區也是國內著名的海濱度假旅遊勝地。區政府駐沙頭角鎮。 全區總面積75.68平方公裏。 轄沙頭角鎮,設2個街道辦事處,21個居民委員會。經濟特區範圍
經濟特區包括羅湖、福田、南山、鹽田4個區，東起大鵬灣背仔角，西至珠江口安樂村，南與香港"新界"山水相連，北靠梧桐山、羊臺山脈，面積327.5平方公裏，東西長49公裏，南北寬約7公裏，呈狹長形。經濟特區與非經濟特區之間建有壹條全長129.7公裏的管理線，在進出經濟特區的8條公路的路口,分別設了檢查站。