2019年1月1日，權健公司在經營活動中，涉嫌傳銷犯罪和涉嫌虛假廣告犯罪，公安機關已依法對其涉嫌犯罪行為立案偵查。同時，相關部門依法查處取締不符合消防安全規定的火療養生場所、開展集中打擊清理整頓保健品亂象專項行動。
1月2日，對在權健腫瘤醫院涉嫌非法行醫的朱某某立案偵查。
2019年1月2日，針對權健公司在江蘇省鹽城市大豐區打造的30米鎏金大佛像給當地相關部門出了“難題”——這尊“藥師佛像”是不是應該移除？鹽城市民族宗教事務局宗教處李姓負責人介紹說，該鎏金大佛像最核心的問題是“它是否露天”。如果該佛像屬於露天的，相關部門可能會采取措施進行整治，比如移除。“如果不是露天的，（我們）沒有任何政策法規依據去處罰他。”李姓負責人說。
2019年1月6日，央視批“然健、權健涉傳銷”，有關部門並沒有因為傳銷出現的新變化而提升監管理念和手段；還有監管機構和監管人員，利用監管手段的落後和模糊地帶，客觀上已經淪為傳銷行為和傳銷組織的保護傘。
2019年1月6日晚，廣東省市場監督管理局也正式發出對權健公司的處理通報，權健廣東分公司目前已處於停業整頓狀態。