第1話 魔神誕生日
布裏塔尼亞帝國的所屬領土,被稱為 11區 的原日本
在布裏塔尼亞的學校,亞修福特學園上學的魯路修,在新宿被卷入與恐怖分子與布裏塔尼亞軍隊的交戰中,與布裏塔尼亞軍中的幼年時的好朋友樞木朱雀在這種情況下重逢了。
在二人的面前,出現了壹位神秘的少女,悲劇也在這時發生。朱雀為了從布裏塔尼亞軍隊那裏庇護魯路修和少女,被軍隊射殺。少女將自己的神秘力量給予了悲憤的魯路修....
第2話 覺醒的白色騎士
新宿戰場出現的恐怖分子之中，有亞修福德學院的學生華蓮。想讓華蓮和她的同伴從布裏塔尼亞軍隊的包圍中逃離的魯路修，用從神秘少女那裏得到的能力，奪得了布裏塔尼亞的nightmare，並給華蓮他們指示。正在這時，難得壹見的高端戰鬥機械蘭斯洛特出現了。
與華蓮及魯路修的機械不同，蘭斯洛特擁有超強的戰鬥能力。而駕駛蘭斯洛特的，卻是之前在地下鐵內被布裏塔尼亞軍隊槍擊的朱雀。
第3話 虛假的同學
從第三皇子庫洛維斯的身邊回到亞修福德學園的魯路修。在學校裏，與實際上是恐怖分子的華蓮相遇了。
華蓮懷疑魯路修就是在之前的戰鬥中，用聲音指揮他們的人。兩個人各自都在探察對方知不知道自己的真實身份。
魯路修使用了 GEASS的能力，成功的瞞過了華蓮。
這個時候，庫洛維斯皇子被殺害的報道公布了，作為犯人被逮捕的，是樞木朱雀....
第4話 他的名字是ZERO
華蓮與新宿戰場的困境中搭救了華蓮他們的神秘男人再次相遇了.以Zero自稱的這個男人的真實身份,正是魯路修.
Zero想借用華蓮他們的力量,把以殺害庫洛維斯的罪名押送到軍事法庭的途中的朱雀搭救了出來。Zero在眾多的布裏塔尼亞人的見證中,承認了自己才是殺害了庫洛維斯的犯人。魯路修運用了神秘少女給予的力量，成功的救出了朱雀,不過朱雀拒絕接受被救,而告訴Zero他選擇去軍事法庭
第5話 皇女與魔女
為了逮捕Zero,布裏塔尼亞的軍隊大勢出動了.這個時候,魯路修在亞修福德學院的自己家中與C.C.再次相遇.她就是將GEASS這種神秘力量給予了魯路修的神秘少女. C.C.沒有理會吃驚的魯路修,在魯路修的房間內坐了下來.....
在另壹邊,被釋放的朱雀與自稱尤菲的少女碰面了，朱雀帶著尤菲去參觀新宿,在新宿被卷進與布裏塔尼亞純血派內部的爭鬥中...
第6話 被奪走的假面
朱雀轉學進入了亞修福德學園.魯路修與朱雀終於能夠活著再次相遇.不過曾經作為殺害了庫洛維斯皇子的嫌疑人,布裏塔尼亞人的同學們並不歡迎朱雀.
就在這種狀態下,魯路修的身邊又發生了壹件大騷動.藏在自修室的Zero的假面被貓亞瑟搶走了,魯路修去追趕犯人想奪回假面.
被帶入到這個騷動中的米蕾和學生會的其他成員,和全校的同學都壹起動員起來，去尋找犯人....
第7話 擊殺柯內莉亞
對潛藏在琦玉集中營裏的恐怖分子,柯內莉亞定出了作戰計劃.與之前的新宿事件非常相似的壹個作戰計劃展開了,實際上的戰鬥目標卻是引Zero出來殺她,由此擊殺Zero.
想要奪取柯內莉亞命的魯路修,來到了琦玉集中營.運用Geass的力量,奪取了壹架布裏塔尼亞軍方的nightmare ,操控恐怖分子,使布裏塔尼亞軍隊後撤.恐怖分子的部隊被破壞,魯路修陷入了不得不投降的地步.
第8話 黑色的騎士團
在河口湖畔的酒店內,從日本解放戰線的成員手中,奪取人質的行動開始了.人質中有亞修福德學園學生會成員及布裏塔尼亞帝國第三皇女的尤菲米亞.向柯內莉亞發出宣言要去救包括尤菲在內的人質的魯路修,帶領著華蓮等黑色的騎士團行動了.沒想到,魯路修與尤菲米亞直接面對時,他的槍口對準了尤菲..
此時,朱雀駕駛著的蘭斯洛特也開始了突擊.
第8.5話 假面的軌跡(第1--8話的總集篇)
本篇是從第1話開始到第8話結束的劇情回顧的總集篇,全篇的主線是魯路修的壹路走過來的故事.
魯路修是怎樣擁有Geass和黑色的騎士團這2種力量也進行了說明
第9話 抑制
Zero自稱他們的組織為＜黑之騎士團＞，聲稱他們是「弱者的夥伴」，並說出了布裏塔尼亞政府如何橫暴的處理軍隊和貪汙政治家，犯罪組織等。這事被世間報道了的結果，令eleven將＜黑之騎士團＞作為英雄壹般稱贊。
卡蓮是eleven和布裏塔尼亞的混血兒，在那復雜的家庭環境生活，令卡蓮十分憎惡布裏塔尼亞，所以卡蓮跟Zero同樣感到有必要改變世界，也要改變社會。
發生賓館脇持人質的事件以後，＜黑之騎士團＞成了世界的話題。想借此讓朱雀認同＜黑之騎士團＞的勒魯什，和朱雀發生了口角。
這時候，＜黑之騎士團＞得到了布裏塔尼亞政府利用日本秘密擴展著毒品”refrain”的消息，決定開始調查這件事，於是秘密潛入出售毒品的現場。在這裏卡蓮看到了販賣者的身影．．．
第10話 紅蓮起舞
朝著日本解放戰線的基地所出的成田連山,柯內莉亞率領的布裏塔尼亞的軍隊展開了奇襲.得到了這個情報的魯路修,率領著黑色騎士團也向成田連山出發了.被柯內莉亞的攻擊打跨了的日本解放戰線的部隊,戰鬥力量幾乎完全被毀滅,贏得戰爭的機會喪失了.
魯路修發出宣言,宣稱戰鬥將奇跡般的獲勝,朝著柯內莉亞,日本最先進的nightmare紅蓮二式出擊了.
第11話 成田攻防戰
在成田山成功讓柯內利亞部隊孤立的黑色騎士團。
魯魯修終於靠近科內利亞，命令她投降，不過，柯內利亞展現出博命戰鬥的覺悟。
在朱雀操縱的蘭斯洛特的猛烈攻擊下，戰況逆轉。
黑色騎士團不得以撤退，不過追趕著ZERO的朱雀被C.C.的未知能力封住行動，朱雀被C.C.的能力侵蝕腦中，如同噩夢般的IMAGE中與死去的父親會面....
第12話 京都來的使者
夏莉熱切的想念魯路修,並約好和魯路修約會.不過,魯路修與黑色的騎士團壹起,為了與京都來的使者會面,而去了富士礦山.京都來的使者,質問出了Zero的真面目.
在壹邊,夏莉所沒有想到的悲劇發生了.
第13話 夏莉和槍口
因為NARITA的戰鬥，對於已發生的事實，使LULU和嘉蓮內心感到很痛苦。貫徹信念決心和布裏塔裏亞抗爭到底的LULU，率領黑色騎士團向KONERIA軍隊出擊。在和朱雀操縱的Lancelot戰鬥的緊要關頭，LULU看到不應該出現的夏莉。而夏莉是從某個人那裏得知LULU和黑色騎士團的關系，而追著LULU來的.....
第14話 GEASS VS GEASS
懷疑被夏利知道秘密的LULU追蹤在夏利的後面。LULU就整個事情的來龍去脈問CC，卻沒有得到回答。那個時候，夏利在成田遇到了神秘的男人－毛。毛是能夠解讀人的思想的GEASS能力者。夏利被他所操縱，為了補償那個罪而決定選擇死亡。CC和以前由自己給予GEASS能力的男人對峙著，而LULU做了和已經知道真相的夏利分別的決斷.....
第15話 喝彩的毛
CC對魯魯說出要破棄與LULU的契約，並要回到曾經簽訂契約的馬奧那裏。聽到LULU呼喚的CC，仍然離開了他。知道馬奧的目的不是LULU而是自己的CC下定了與馬奧再會的決心，他把為了目的不擇手段的馬奧看作危險的存在，打算追趕他的去向。但是，毛能夠讀取ZERO的心並采取相應的行動，導致抓住他非常困難,聽從馬奧的指示前往遊園地與毛再會的CC將槍口指向了馬奧.....
第16話 被囚的娜娜莉
馬奧讀取心的能力被LULU抓住破綻並打敗，他想對LULU實施報復。馬奧侵入娜娜莉所在的班級並誘拐了她。從班上回來的LULU察覺到娜娜莉不在而開始尋找她，這時馬奧透過手機打來了電話。馬奧提出2小時內找出自己與娜娜莉的所在場所的遊戲。擔心娜娜莉的LULU開始拼命地在校園裏尋找....
第17話 騎士
藤堂被不列顛軍捕獲並準備處刑。藤堂的同伴LULU向提出救助藤堂的請求，LULU接受了他們的依賴。然後，在獨房裏準備對藤堂行刑時，紅蓮破壞了建築物的墻壁。出現在紅蓮弐式的肩上的LULU，從不列顛軍人手裏將藤堂救出，並希望他加入黑色騎士團。被藤堂拒絕壹次的LULU，成功把握到騰堂過去的傷痛，說服了他加入騎士團。
第17.5話 假面的真實
本篇屬於總集篇，藉由魯路修的第壹人稱視點來為之前幾話做回顧；在本篇回顧中魯路修也說明了自己本身必須同時兼顧兩種角色：ZERO和學校的學生會副會長，有時甚至要當負責照顧娜娜莉的好哥哥，但是魯路修知道自己總有壹天必定不會待在娜娜莉的身邊，所以魯路修需要壹個人來當娜娜莉的護衛，而首選，正是自己從小到大的好朋友--------樞木朱雀，劇中也有提到朱雀為何會殺死自己的父親，以及魯路修對於這件事情的整體看法，魯路修認為這是壹個很好的契機；但是卻在搶救「嚴島的奇跡」藤堂的時候，魯路修也得知，原來，處處阻撓他的計劃的這個白色機體駕駛員，正是朱雀，在這壹瞬間魯路修的計算整個錯誤，而魯路也了解到朱雀最後選擇了尤菲米亞作為自己護衛的對象，而朱雀的這個選擇，會讓魯路產生什麽樣的抉擇呢．．．．．．
第18話 勒令樞木朱雀
本篇壹開始，ZERO針對「黑色騎士團」做了人員重新分配，同時，樞木朱雀被尤菲米亞王女認定為守護騎士；「黑色騎士團」內部給了ZERO暗殺朱雀的建議，但是ZERO並未給予回復；尤菲在任命騎士後向柯內莉亞表達自己想改變這個國家的真正決心；鏡頭拉回不列顛帝國的某處，皇帝針對第二皇子「修奈傑爾」說出了令人匪夷所思的話語；由娜娜莉策劃的恭賀會也於此時開始，而妮娜與洛伊德的接觸，埋下了為「蘭斯洛特-加龍省」強化的伏筆，然後華蓮為了ZERO要執行暗殺朱雀的行動，但是卻馬上被魯路修制止沒有成功；ZERO也否決了暗殺朱雀壹事，並針對迪德哈爾特提出質疑，而迪德哈爾特也表明了為何願意加入「黑色騎士團」的真正原因；朱雀壹行人壹到目的地，ZERO的計劃正式執行，並成功抓到朱雀以及「蘭斯洛特-加龍省」，ZERO重新說服朱雀加入「黑色騎士團」，但還是失敗，此時二皇子「修奈傑爾」等場，到底朱雀、尤菲米亞、「黑色騎士團」以及ZERO的命運將會如何呢？
第19話 神之島
前回魯路修、朱雀、尤菲以及華蓮遭受到修奈傑爾的炮擊，以至於四個人漂流到壹個未知的島上，朱雀碰上華蓮，魯路修則是碰上尤菲，朱雀因此得知華蓮是黑色騎士團的人，尤菲也知曉ZERO的真正身分是魯路修；魯路修想從尤菲口中詢問出是誰殺了魯路修的母親，但是尤菲不知道，不過柯內莉亞似乎調查了不少相關的事情，這是怎麽回事呢？另外壹方面，朱雀也想從華蓮口中詢問出ZERO的真實身分，卻也無從得知，朱雀也在這個時候勸華蓮退出騎士團，但是華蓮不接受；修奈傑爾壹行人也到了魯路修等人漂流到的島，探查到了壹個神秘的遺跡；就在魯路修壹行人交換人質的瞬間，地板上的GEASE符號啟動，壹行人也從上面落下，碰到了修奈傑爾；魯路修離開時順手把GAWAIN給開走，讓不列顛人又落了個空；就在朱雀以及尤菲平安的被救出以後，修奈傑爾卻下令逮捕朱雀，原因是他放走了ZERO，至於原因，則是魯路修對朱雀下了GEASE，要朱雀「活下去」，當然朱雀本人壹點記憶都沒有。
第20話 九州戰役
以前在日本擔任官房長官的男人·澤崎耕太郎，在大宰府基地宣言了日本的復興。
那個時候,朱雀向尤菲毫不隱瞞地說出7年前自己殺死父親的事,將她給予的騎士候位歸還.尤菲看著朱雀返還自己給的騎士證,受到了打擊.並且,科奈尼亞完全不讓尤菲對自己部下下命令.她被部下稱作\"裝飾的副總督,她自己也為不能改變不列顛現狀而苦惱.
另壹方面,LULU和黑色騎士團乘坐潛水艇向九州前進.在裏面進行著會議,扇問LULU前往九州的目的,於是LULU向他們宣告了沖擊的內容.從他那令人震驚的發言中，勒魯什透露了毀滅布裏塔尼亞，並宣言了自己內心所隱藏的決心。
20話中..夏莉的日記內容:
我感到震驚。 我仍然有些眩暈。 只要想到妳，魯魯就是Zero！ 我還沒有告訴別人，因為我想和妳見面，親耳聽妳說。 妳會告訴我壹切的，對嗎，魯魯？ 我肯定這裏面壹定有什麽原因，不是嗎？ 我可以等待。我們最好可以面對面地交流，不過就算只能在電話裏交談也沒關系。 我想要妳親口說出來。 妳為什麽會變成Zero？妳為什麽成立了黑色騎士團？我的父親為什麽必須得死？這讓我陷入了沈思。 我父親死了，然後是戰爭，布裏塔尼亞，11區住民。 但這壹切只會讓我暈頭轉向，到最後，我無法冷靜地思考。 可事實是，壹定有什麽我了解的東西。並且那是...那沒有簡單的答案。 很難說什麽是對的，什麽是錯的。這就是我想聽妳回答的原因。 魯魯，妳為什麽會變成Zero？
第21話 學園祭宣言
在澤崎政權被摧毀壹事成了世間的話題之時，阿修佛德學園舉辦起了文化祭。
每年都有個活動就是駕駛第3代KMFガニメデ的公開表演，駕駛員是魯魯修，但今年換人了。
PS：第3代KMFガニメデ未投入正式生產前的駕駛員是魯魯的媽媽。
而尤菲則偷偷地潛入學園，並與娜娜莉重逢。因尤菲的闖入，而發生了意料之外的大騷動。
會長壹邊享受著學園祭壹邊挑戰\"世界最大的比薩\",這個關於比薩的夢想能夠實現嗎？
第22話 血染的尤菲
日本特區要正式成立了，尤菲這項突如其來的宣言，造成了黑色騎士團內部的不穩定；魯路修對於這項宣言抱持著強烈反對的態度，因為這樣只是讓歧視更為嚴重罷了；典禮當天，ZERO出席了，而ZERO也要求跟尤菲壹對壹對話；朱雀可以能夠看見C.C.，這是怎麽回事呢？於此同時，魯路修的GEASE發生異常，而魯路修也由於自己的不小心對尤菲下了壹個最糟糕的命令，是什麽命令呢？而遠在不列顛的皇帝對於這件事情似乎了解到了什麽事情？這些疑點，將慢慢的真相大白！
第23話 至少帶著悲傷
由於突然發生的事件,特區陷入了前所未有的大混亂，在這時,神楽耶出現在對不列顛的行動感到憤怒的日本人面前，指名ZERO為新的日本人的引導者，因為神楽耶的呼喚而出現在日本人面前的LULU,作出了脫離不列顛獨立。
以下為推測劇情 ，24/25大概是起到壹個承前啟後的作用吧
因為神楽耶的呼喚而出現在日本人面前的LULU,作出了脫離不列顛獨立的決定。
橙子代替朱雀被選為LANCELOT的架駛員的人。
橙子用著被改造過的肉體的驚人能力，將LANCELOT的戰鬥能力提升到最高。
被LANCELOT追趕的魯魯們（大概是指黑之騎士團），遇見了壹個女的...
第24話 叛逆的盡頭
取回記憶的橙子進入暴走狀態。
為了停止暴走中的LANCELOT，軍部只好叫出朱雀。
在那時，勒魯什率領著黑之騎士團，迎接與軍隊的最終決戰...
第25話 CODE GEASS -叛逆的勒魯什-
跟著與柯內利亞的悲壯死別，在結果上說，日本被勒魯什他們解放了。 他和朱雀壹起，乘坐Avalon往本國飛去。
被洛伊德和拉庫夏塔改良的GAWAIN和LANCELOT，以黑與白的騎士站立在布利塔尼亞上。
為了完成他與CC的契約，為了找出母親被殺的真相，為了與身為父親的布利塔尼亞展開最終的叛逆...