根據《中華人民共和國城鄉規劃法》第六十八條規定，城鄉規劃主管部門作出責令停止建設的決定後，當事人未停止建設或者限期拆除的，建設工程所在地的縣級以上地方人民政府可以責成有關部門采取查封施工現場、強制拆除等措施。在違法建築的拆遷補償中，要註意區分拆遷補償和拆遷補助。雖然我國《城市拆遷管理條例》明確規定拆除違法建築不予補償，但這只能說明違法建築者得不到拆遷補償，拆遷人仍要依法向違法建築者支付拆遷補助費。拆遷補助包括搬遷補助費和臨時安置補助費等費用。拆遷人不得因違法建築而拒絕向違法建築人支付搬遷補助費和臨時安置補助費。拆遷補償是指依法拆遷，並應向被拆遷人和房屋承租人支付的補償；拆遷補償是指在拆遷過程中，拆遷程序和手段違法，侵害被拆遷人和承租人合法權益時，應當依法賠償損失。本文的拆遷補償僅限於討論對違法建築者的拆遷補償。超過兩年未發現和處理違法建築的，行政機關不能再按違法建築處理。現在要拆的話，應該是要補償的。法律:《國有土地上房屋征收與拆遷補償條例》第十九條對被征收房屋價值的補償，不得低於房屋征收決定公告之日同類房地產的市場價格。被征收房屋的價值應當由具有相應資質的房地產價格評估機構按照房屋征收評估方法評估確定。對評估確定的被征收房屋價值有異議的，可以向房地產價格評估機構申請復核評估。對復核結果有異議的，可以向房地產價格評估專家委員會申請鑒定。房屋征收評估辦法由國務院住房和城鄉建設主管部門制定。制定過程中，應當向社會公開征求意見。對違法建設但土地有合法使用權或財產權的，應當給予適當補償。因拆遷造成土地使用收入損失的，應當給予適當補償。在拆遷補償中，要註意區分違法建築和土地使用權範圍內的建築物。違法建築按照有無土地使用權的標準，基本可以分為兩類:壹類是已取得土地使用權的違法建築，壹類是未取得土地使用權的違法建築。如果違章建築有合法的土地使用權，那麽即使在拆遷時違章建築本身沒有得到補償，也必須考慮違章建築的財產利益。以劃撥方式取得土地使用權的，拆遷人可以不補償使用土地的違法建築者；但通過出讓方式取得土地使用權，且違法建設人已足額繳納土地出讓金，但出讓期限未滿的，拆遷人應當賠償違法建設人因拆除違法建築所造成的土地使用收益損失。
法律依據:《城市異產毗連房屋管理條例》
第五條業主、使用人使用和修繕房屋，必須符合城市規劃、房產管理、消防、環保等部門的要求，按照有利使用、協商公平的原則，正確處理相鄰關系。