1、登錄指定的網上服務平臺；
2、填寫《中國公民因私赴港澳地區申請表》；
3、上傳數碼照片，照片要求為二寸正面免冠平面彩色近照，藍色背景，著深色有領上衣，照片大小48X33mm，頭部寬度21-24mm，頭部長度28-33mm；
4、提交身份證和戶口簿的復印件，復印件應為A4規格，身份證需復印正反面，戶口簿需復印戶主頁和申請人所在頁；
5、按照提示完成簽註費用的在線支付；
6、等待審核通過後，根據系統提示領取港澳通行證及簽註。
網上自助簽註港澳通行證的註意事項：
1. 確認個人資料的準確性，包括姓名、身份證號碼、通行證號碼等；
2. 核對簽註類型是否符合出行目的，如個人旅遊、探親、商務等；
3. 檢查簽註有效期，確保其覆蓋整個預計的出行時間；
4. 註意簽註次數，如壹次性簽註或多次簽註，並了解每次逗留時間限制；
5. 確認網上申請系統的申請截止時間，避免錯過申請期；
6. 保持通訊暢通，以便接收申請進度更新或需要補充材料時的通知；
7. 在完成網上申請後，應及時打印或保存申請記錄，以備不時之需；
8. 網上支付簽註費用時，應註意選擇正確的支付方式，並保存支付憑證；
9. 簽註完成後，應檢查簽註信息是否與申請時填寫的壹致；
10. 網上自助簽註成功後，應按照指示完成後續的領取或郵寄手續。
綜上所述，網上自助簽註港澳通行證的步驟包括登錄指定的網上服務平臺、填寫申請表、上傳照片、提交身份證和戶口簿復印件、在線支付簽註費用，待審核通過後領取通行證及簽註。
法律依據：
《中國公民因私事往來香港地區或者澳門地區的暫行管理辦法》
第二十二條
前往港澳通行證在有效期內壹次使用有效。往來港澳通行證有效期五年，可以延期二次，每次不超過五年，證件由持證人保存、使用，每次前往香港、澳門均須按照本辦法第六條、第八條、第十條的規定辦理申請手續，經批準的作壹次往返簽註。經公安部特別授權的公安機關可以作多次往返簽註。