目前，旅遊景區的機構和制度存在三大缺陷。第壹，除了政府類型的管理機構，景區設立的機構大多缺乏法人地位，是事業單位但行使行政職能。二是規劃管理和監督缺乏程序，往往出現事後諸葛亮的尷尬局面。三是管理機構政企不分，行政管理和業務管理混淆，削弱了統壹管理職能。政企不分把景區管理機構和壹般管理機構混為壹談，從公眾利益出發失去了嚴格公正執法的定位，客觀上削弱了管理機構的行政職能。
2.相關法律法規缺乏銜接和協調。
旅遊景區管理中統壹管理的難點主要是規劃和管理權屬的交叉，這主要是由於相關法律法規缺乏銜接和協調。
尤其是自然保護區、城市和村鎮之間缺乏與相關法律法規的銜接和協調最為突出。