赴港澳旅遊通常選擇L簽註或G簽註即可。開通港澳自由行的城市可申請G簽，未開通的城市則申請L簽。
赴港澳的簽註種類***分4種：L簽註（即團隊旅遊簽註，必須隨旅行團進出）；G簽註（即個人旅遊簽註，不受跟團旅遊限制，可赴港澳自由行）；S簽註（即商務簽註）；T簽註（即探親簽註）。
港澳通行證的簽註代表前往的目的地與可前往的次數。在申請辦理港澳通行證填寫申請表格時有壹項選擇是選擇所要前往的目的地，如果選了香港，那麽通行證的簽註就是香港簽註。選擇澳門的話同樣就是澳門簽註。
當通行證上的簽註是香港的話，那麽就只能前往香港旅遊，如果是澳門簽註，那也是只能去澳門，不能去香港。在簽註上會註明可以前往的次數，目前辦理的通行證來往次數都是2次。次數用完了是可以續簽的，也可以把兩次來往次數簽註選擇為香港或澳門各壹次。
有效期限
1、證件有效期：往來港澳通行證有效期5年。2014年9月15日，全面啟用電子往來港澳通行證規定，成年人電子往來港澳通行證有效期延長為10年，對未滿16周歲的仍簽發5年有效通行證。現用的本式往來港澳通行證將於2019年9月13日全部失效。
2、簽註有效期：內地居民往來港澳簽註分為6個種類，即個人旅遊（G）、探親（T）、商務（S）、團隊旅遊（L）、其他（Q）、逗留（D）根據申請事由分類簽發。
其中香港G簽和L簽的有效期都為：3個月1次、3個月2次、1年1次、1年2次四種有效簽註。澳門簽註只有3個月1次、1年1次申請。簽註規定每次在香港或者澳門逗留不超過7天，壹進壹出算壹次。