藍田縣是地質災害多發區，藍田猿人遺址位於秦嶺北麓的地下地帶。全山由松散礫石組成，場地開挖基礎黃土層以下礫石層松散不穩定。由於其特殊的地質結構和近年來降雨的影響，地面沈降嚴重。2004年，連續降雨導致部分地基塌方，所幸無人員傷亡。2005年藍田縣發現滑坡、崩塌等地質災害隱患168處，其中包括藍田猿人遺址。
場地地面沈降已造成展廳部分立柱錯位，斜坡臺階沿線道路開裂。降雨集中或較大時，形成大面積滑坡。展廳內外的墻、柱大多出現了寬大的裂縫，甚至現場工作人員工作生活的房屋也出現了傾斜。現場最寬裂縫約2.5厘米，展廳西南側四根承重柱上有30多條輕裂縫。雖然有簡易房屋保護藍田猿人頭骨，但部分窗戶玻璃破碎，土層風化剝落嚴重。但出土化石的地方沒有任何遮蓋，雨水侵蝕留下的痕跡清晰可見。因為從展廳到出土化石的觀光臺階的整個斜坡都處於滑坡帶，所以隨著斜坡不斷滑動，這種裂縫或多或少都會出現。如果不進行處理，裂縫拉伸後將面臨邊坡坍塌。展覽館的房子會全部倒塌。加大宣傳力度，加大資金投入，加強內部管理。
2003年，縣委縣政府召集該部門工作人員進行研究討論，提出了壹系列實施意見。
第壹，加大包裝的宣傳和策劃。藍田縣將按照藍田旅遊總體規劃，繼續挖掘藍田猿人歷史內涵，科學包裝猿人遺址項目；
第二，加大資金投入，加快基礎設施建設。為了有效保護國家重點文物，堅持保護與開發並重的原則，縣編委還對遺址的財務制度進行了調查，藍田縣開始將原來的定額補助制改為全額撥款制；
第三，加強內部管理，不斷提高服務水平。不僅要“拯救”藍田猿人遺址，還要讓藍田縣更多類似的旅遊景點得以生存和發展。
藍田猿人遺址保護管理方案預算
2006年，藍田猿人遺址文物管理所通過與藍田縣礦業管理局、陜西省第二工程勘察院聯系，為有效治理藍田猿人遺址滑坡災害，制定了系統的工程管理保護方案。僅調查管理經費就需要300多萬元。根據陜西省地質礦產第二工程勘察院設計的治理方案，防治工程概算約340萬元。勘察費用約為654.38+0.7萬元，兩項加起來約350萬元，其中最主要的是遺址保護的註漿加固工程，共花費約220萬元。藍田猿人遺址保護治理方案總預算約350萬元，調查費約1.7萬元，防治工程約340萬元，灌漿加固工程約220萬元，其他保護費約1.7萬元。參觀藍田猿人遺址的遊客少了，遊客減少的同時門票收入也會相對減少。藍田猿人遺址每年只有門票收入，平均每年2萬元左右，縣財政補貼每年2萬元，共計4萬元。門票收入緊張用於支付員工工資，當然也不是為了網站的維護。2004年，該工地受災時，甚至有7名員工的工資被不同程度拖欠，因此進壹步的整體加固等工作被推遲。類似的隱患已經向上級反映過多次，但沒有引起足夠的重視。
陳家窩——陳家窩遺址在壹座陡峭的大山中間。網站上沒有提示和圖標。考古結束後，沒有采取任何保護措施，地質剖面依然任其在風雨中自生自滅。因為很多原因，這裏即將成為垃圾場。(2015)公王嶺-山路路況較差。可以隨意停在站點門口。遺址內只有展廳和後山(出土“藍田人”化石的地方)的八角亭。除了工作人員，沒有遊客，大概半個小時就能完成遊覽。(2014)陜西“藍田猿人”的發現，無疑豐富了人類學的知識寶庫。作為迄今為止在亞洲北部發現的最古老的直立人，它是中國三大猿人遺址之壹。如果不加以保護，將對今後的科研、維修、治理以及工作人員和遊客的安全造成極大的威脅。