我認為是第五次變大是清水寺篇，終於等到了修學旅行的日子。世良真純、服部平次和工藤新壹三位高中生偵探聯手解決有希子老同學帶來的案件。本次事件還有鈴木園子、大岡紅葉、遠山和葉、伊織無我、沖田總司、綾小路文麿、工藤優作、工藤有希子、瑪麗·世良等眾多人物登場。新壹和蘭終於。。。與此同時沖田與鐵劍的關系明朗，平次和葉的戀愛進度遭到挑戰，世良母子對工藤新壹產生懷疑。信息量巨大啊！（927-928紅色的修學旅行）
不容易啊，2017.8.5更新1000話漫畫。柯南為了和小蘭去修學旅行，拼命討好哀醬要來了解藥，第五次變大成功啦！！！
柯南真正變大回到工藤新壹的狀態，整部作品中到目前為止只有四次（2019.1.5更新：動畫第五次變大），其他的出現基本都是小蘭回憶過去的案子什麽的。
既然題主問的是哪幾集，那我就按照TV版來說吧（劇集順序按照日本電視版）
第壹集沒變小不算。。。但是屬於工藤新壹在present時間線出場，把它放進來了
第壹次變大是在服部平次首次登場，來找工藤新壹的時候。順手拿了壹瓶白幹來，感冒中的柯南喝了，後來就發生了不可描述的事件。。。（048-049 外交官殺人事件）
第二次變大是危命的復活系列（190-193 危命的復活）這次新壹和蘭差點就。。。嗯，就這樣吧。不過結尾柯南再次出現的時候還是充滿唏噓，成為了經典場景。
第三次變大就等了好幾年了，（521-523 殺人犯工藤新壹）沒想到工藤新壹這麽遭人恨，還不得不佩服日本的整容技術也不賴。這次同時發了新蘭和平和的糖。
第四次變大（616-621 福爾摩斯的默示錄），蝸殼終於圓夢，來到了夢寐以求的倫敦，如果想去倫敦旅行的朋友們可以好好看看這幾集，難得把旅遊元素和推理元素結合得這麽好，和動畫組的旅遊篇就是不壹樣。
謝謝
補充：雖然不是劇集更不是漫畫原創，但是迷宮的十字路口也勉強算進來吧。
補充二：OVA9 十年後的陌生人裏，柯南生病發燒，向灰原要藥，短時間恢復但是做了個極悲哀的夢。OVA非原創不算進來。以上純屬個人觀點！