《大白鯊》的主體拍攝工作於1974年5月2日在馬薩諸塞州的馬薩葡萄園島展開，劇組之前還曾考慮過紐約州的長島東部。布朗之後表示，劇情需要壹個經濟規模在中等偏下的度假區，如果出現鯊魚，當地的旅遊業將毀於壹旦。馬薩葡萄園島獲選的另壹個重要原因是：其海岸周圍遠至19公裏範圍內的沙質海底距海面的距離壹直都在11米以上，這對道具鯊魚的操作非常有利。導演希望片中的水面和水下鏡頭可以有相對的特寫效果，能夠類似於人們在遊泳時所見到的情景，攝影師比爾·巴特勒為此設計了新的裝備，以便在海上和水下進行拍攝，其中包括可以在遇到潮汐時仍然保持攝像機固定的鉆臺和密封的潛水攝影機盒。斯皮爾伯格要求藝術指導部門避免在布景和衣櫃中用到紅色，這樣鯊魚攻擊時出現的血液就會是鏡頭中僅有的紅色元素，給觀眾構成更大的沖擊。
馬薩葡萄園島上的小漁村梅內莎是本片的主要取景地點。
工作人員壹***制作了三條全尺寸的氣動道具鯊魚，劇組以斯皮爾伯格的律師布魯斯·萊默（Bruce Raimer）給鯊魚起名叫“布魯斯”，壹條是全尺寸的“海上滑行鯊”，主要使用壹根長約100米的線纜拖動，這條鯊魚沒有下腹部；另外兩條“平臺鯊”，壹條用於拍攝從左往右看到鯊魚的鏡頭，其左側不會出現在鏡頭中，可以看到內部暴露出的多組氣動軟管，另壹條則相反，用於拍攝從右往左看到鯊魚的鏡頭，其右側暴露出內部機械結構。這些道具鯊魚都是由藝術指導設計師喬·阿爾夫斯（Joe Alves）於1973年7到9月設計，再從1973年11月到次年4月由位於加利福尼亞州太陽谷的羅利·哈珀電影設備租賃公司制作。***有多達40名特效工作人員壹起參與了制作，因制作1954年版《海底兩萬裏》（20,000 Leagues Under the Sea）中的巨型章魚聞名的鮑勃·馬提（Bob Mattey）負責監督。道具鯊魚制作完成後再用卡車運到外景拍攝地。1974年7月初，用來拖動兩條側視鯊魚的平臺在降至海底的過程中翻沈，劇組只好派壹隊潛水員下海搜索。這些模型的全部活動配件壹***需要14位操作員來控制。
電影的拍攝過程困難重重，成本大幅超支。大衛·布朗曾表示電影預算“是400萬美元，但實際上卻花了900萬美元”，由於機械鯊魚存在問題，單特效支出壹項就達到了300萬美元。心懷不滿的劇組成員還給電影起了個叫“缺陷”（Flaws，原英文片名為“Jaws”）的綽號。斯皮爾伯格把許多問題歸咎於自己的完美主義和經驗不足。他的完美主義作派集中體現在堅持要用實際大小的道具鯊魚在海上拍攝，稱“我本來可以在水箱或是哪個受保護的湖泊裏拍這部電影，但這樣看起來就是會不壹樣”。而對於自己缺乏經驗的問題，導演表示：“基本上來說，我對大海的看法還很天真。我天真地以為自己能夠征服大自然，但這只是壹種有勇無謀、狂妄自大的表現。而且真正的問題在於，當我要求大家跑到大西洋，而不是北好萊塢的某個水箱裏拍攝這部電影時，我還太年輕，意識不到自己的魯莽。
在海上拍攝導致了多方面的延誤：外來船只進入鏡頭視野、攝影機進水，“逆戟鯨號”又壹次和船上的演員們壹起沈入水中。道具鯊魚經常因各種原因導致頻繁出現故障，如惡劣天氣、氣動軟管受到海水腐蝕、框架因水壓破裂，皮膚受到腐蝕和電解。從最初的試水開始，使用號稱“不吸水”的氯丁橡膠泡沫制成的鯊魚皮膚就吸收了海水，導致鯊魚膨脹，水下的海藻經常會纏住“海上滑行鯊”。據斯皮爾伯格之後的計算，每天12個小時的工作日程中，平均只有4小時的確是用在拍攝上。哥特列布差點讓船的螺旋漿削掉腦袋，德萊弗斯也幾乎被鎖在鋼筋籠子裏出不來。幾位演員都經常暈船。肖因遇到稅務方面問題，只要有機會就會逃往加拿大，這期間德萊弗斯正因在《學徒》中的表演獲得如潮好評，肖則開始酗酒，對德萊弗斯的成功心懷怨恨。剪輯師弗娜·菲爾茲在電影的主體拍攝期間很少有可以工作的素材，據斯皮爾伯格所說：“要是壹切順利，我們壹天能拍5個鏡頭，壹般情況下則只有3個，要是不順利，那就壹個都拍不出來”。
吊在塔架上的機械鯊魚。
事實證明，電影拍攝過程中的延誤也帶來了壹些意外收獲。劇本在制作過程中得到改善，機械鯊魚可靠性欠佳也迫使斯皮爾伯格在拍攝許多場景時只是暗示鯊魚存在，例如大部分捕殺鯊魚的鏡頭中都是用黃色浮桶來代表其位置。電影開場時原計劃有壹場鯊魚吞食克裏茜的鏡頭，但之後經過改寫，用突然拉起的線纜來模擬鯊魚的攻擊。斯皮爾伯格還在片中使用了多個只能看到背鰭的鏡頭。對電影的評論中普遍認為，這些限制性的鏡頭雖是不得以而為之，但卻增強了影片的懸念。導演自己也在多年後表示：“這部電影在原本的日本周六日場驚悚片基礎上搖身壹變，成為壹部更具希區柯克風格的作品，壹部看得越少、得到的越多的驚悚片”。他還在另壹次接受采訪時表示了類似的看法：“鯊魚不能工作可謂是天賜良機。電影變得更像阿爾弗雷德·希區柯克，而不是雷·哈利豪森”的作品。要讓觀眾相信有壹條如此巨大的鯊魚，演員的演技也就變得至關重要：“水中的鯊魚看起來越是虛假，我就越是焦慮地告訴自己必須提高（演員）表演的自然程度”。
鯊魚專家羅恩·泰勒（Ron Taylor）和瓦萊麗·泰勒（Valerie Taylor）夫婦在澳大利亞海域拍攝了真正鯊魚的鏡頭，並且通過使用小個子演員待在小型鯊籠內來制作鯊魚體形龐大的錯覺。泰勒夫婦在拍攝期間遇上了壹條真正的大白鯊，船和籠子都受到攻擊。這些攻擊的畫面是如此驚人，以至於導演迫切地想要將其用到電影中。籠子受攻擊時裏面並沒有人，而劇本中又和小說壹樣有鯊魚殺死胡珀的內容，所以這壹情節也就經過改寫，胡珀成功從籠裏逃生，泰勒夫婦拍下的鏡頭也就相應用到了電影中。正如執行制片人比爾·吉爾摩（Bill Gilmore）所言：“澳大利亞水下的那條鯊魚改寫了劇本，挽救了德萊弗斯的角色”。
雖然主體拍攝工作計劃用55天完成，但實際上卻延誤了159天之多，直到1974年10月6日才殺青。斯皮爾伯格對此壹度表示：“我以為自己的電影生涯就到此為此了。我聽到了傳言……說我再也別想找到活幹，因為從來沒有誰拍個電影超期上百天之久”。電影拍攝的最後壹個鏡頭正是片尾鯊魚爆炸的場景，但拍攝時導演本人並不在場，因為他覺得劇組打算拍完那個鏡頭就會把他給扔到水裏去。從此以後這也成為他的壹個習慣，只要是自己導演的電影拍到最後壹個鏡頭，他就會故意缺席。之後，劇組在位於加利福尼亞州卡爾弗城的米高梅水箱和聖卡塔利娜島附近拍攝了水下鏡頭，特技演員迪克·沃洛克（Dick Warlock）和弗蘭克·詹姆斯·斯帕克斯（Frank James Sparks）作為德萊弗斯的替身，拍攝鯊魚攻擊鋼籠的那場戲。弗娜·菲爾茲已經完成了電影前三分之二的粗剪，再從追捕鯊魚的段落開始完成剪輯工作，並對部分素材重新加工。據賽納克所說，“她實際上把壹些史蒂文本是作為喜劇來拍攝的鏡頭加以重建，令其變得可怕，又將壹些本來可怕的場景變成了喜劇鏡頭”。劇組把用來充當“逆戟鯨號”的船帶回了洛杉磯，以便音效團隊錄制船只和水下場景的聲音。
電影中有兩個鏡頭在試映後進行了修改。壹處是因觀眾的尖叫聲蓋過了沙伊德爾的臺詞“妳得找艘更大的船”，布羅迪在鯊魚在從身後躍出水面後相應反應的鏡頭時間有所延長，並且沙伊德爾臺詞的音量也予調大。斯皮爾伯格還決定要讓觀眾再“多來壹次尖叫”，重拍了胡珀發現本·加德納屍體的鏡頭，但環球影業拒絕承擔相應費用，所以導演自掏了3000美元腰包，這個水下鏡頭是在菲爾茲位於洛杉磯聖費爾南多谷恩西諾（Encino）的遊泳池裏拍的，先用膠乳制作克雷格·金斯伯裏的頭部模型，然後將其連接壹個道具屍體上，再壹起擺放到失事船只的船體內。導演還把奶粉倒入遊泳池，以求獲得瑪莎葡萄園島的混渾水域效果