東莞南站位於中國廣東省東莞市塘廈鎮林村社區，距離東莞市區約40公裏。是中國鐵路廣州局集團有限公司管轄的火車站，是京港高鐵、廣深鐵路的樞紐站，是東莞市東南部地區的綜合交通樞紐。東莞南站於2020年4月26日開工建設，2021、12、10投入運營。東莞南站是東莞距離深圳最近的火車站，乘車僅需15分鐘即可到達深圳北站，為東莞市民出行和兩地經濟交流創造了更加有利的條件。
虎門站位於中國廣東省東莞市虎門鎮白沙社區站北路1號。是中國鐵路廣州局集團有限公司管轄的車站，是廣深港高鐵的中間站，是東莞市西南部的交通樞紐。虎門站建於2009年，2010年主體工程完工，20165438年2月26日投入運營。虎門站是集高鐵、城軌、地鐵於壹體的區域性綜合交通樞紐。是廣深港高鐵在東莞設立的唯壹車站，是廣深港高鐵、東莞軌道交通2號線、廣莞深城際鐵路的交通換乘站。推進虎門站及其周邊的綜合開發建設，是虎門鎮乃至東莞市融入粵港澳大灣區的重要舉措。
總之，東莞南站和虎門站是兩個不同的火車站，地理位置不同。