（1）保護性原則。由於農村人文資源的稀缺性和脆弱性，在旅遊開發和建設中對資源應以利用為主，謹慎開發，堅持“少即是多”的原則。在旅遊開發時要盡量保持旅遊資源的原始性和真實性，不僅保護大自然的原生韻味，而且要保護當地特有的傳統文化，避免因開發造成“文化汙染”。各農家生態旅遊熱點區域應建立環境監測網絡，監測範圍主要包括重要景點保護區、分散遊覽區等。內容涉及動植物生長繁殖情況，大氣、水體及土壤汙染的潛在危險及地質災害等情況。
（2）承載力控制原則。即把旅遊開發和利用的強度、遊客進入的數量控制在資源及環境的自然與文化的“生態承載力”範圍內。農家生態旅遊的發展符合當地社會道德規範，必須考慮當地旅遊承載力，使旅遊活動的開展不至於與當地道德、習俗、宗教信仰、文化傳統、生活方式等沖突，如在特色景點要對遊客流量進行嚴格管理，以提高門票價格或限量售票形式，力爭把遊客量控制在生態環境承載力、社會承載力、設施承載力範圍之內。壹則保證遊人最佳觀賞效果，二則防止遊人過多導致果樹采摘過度、草地枯死、土壤板結現象的出現，避免破壞旅遊生態，使農家生態旅遊健康、可持續發展。
（3）社區居民參與原則。保護和鞏固地方特有的民族文化旅遊資源的吸引力；在讓社區居民從旅遊中收益、實現旅遊扶貧功能的同時，使其具有更加自覺保護的動力。
（4）資源和資源有價原則。應該貫徹“旅遊開發，資源有價”的原則，只有充分認識“資源有價”，開發者、管理者、旅遊者才能更自覺地去保護它；只有有償使用資源，使資源在被使用時獲得效益，才能使資源的保護有經濟支撐，才能減少粗放的、破壞性的開發，避免低水平開發和低水平管理帶來的對資源的破壞。