東華寺是南朝梁武帝田健元年(公元502年)由印度醫學家三藏禪師創建的。東華山因其山形地貌酷似印度靈鷲山而得名靈鷲寺。唐隆碩元年，六祖慧能在黃梅隱退，重修靈九寺，改名東華寺，後至寶林寺(南華寺)。此後流傳:先東華，後華南；東華證道，南華傳法。該寺興盛於唐宋，毀於明清。
公元1997年，在福建漳州和西藏林芝隱居了四年的萬興大師再次閉關於此山。2002年，他開始籌備重建千年古剎。2006年9月工程開工，2008年6月東華寺正式竣工，占地300多畝，建築面積2萬多平方米，投資1億多元。
清朝天順年間，改為東華院。文革期間，佛寺被毀，只剩下壹片廢墟。
1997年，萬興大師來到東華山乳珠巖洞閉關。為了重現翁源古剎的輝煌，萬興大師決定修復東華寺。
按照萬興法師的設想，東華寺將在舊址重建，在東華山景區6平方公裏的規劃區域內，建設東華禪修中心、療養中心、慈濟護理中心、佛教文化交流中心、佛學院、佛教藝術展示中心、龍現古鎮、東華七十二塔、東華居士林等8座配套建築。
2008年6月2日，10，在翁源縣委、縣政府的大力支持下，經過四位弟子八年的艱苦努力，古老、古樸、典雅、莊嚴、神聖的東華寺落成。
東華寺典故:
唐隆碩元年，六祖慧能在黃梅接掌衣缽，南返此寺隱退，改靈九寺為東華寺，後赴林寶。從此，翁婿有了傳說:先有東華，後有華南，東華在華南傳法。唐宋盛世毀於明清。
1997年，薩滿萬興帶著心願回來，入此山三年，感受天地之恩，遇陰陽之和，證佛法緣起，於是出關，重修東華。師傅手裏拿著刀斧，開山砍路。昔日無人區，定海中秋，寺廟重現，菩提蒼翠，樹隱，僧聚。
老師們沿襲祖上的禪:農禪並重，上課打坐，上課做，不吃飯做；建立東華之風:先信教，先愛國，先學佛，先做人，先修佛。萬興法師沿襲祖輩的禪宗，“農禪並重，上課坐禪，上課做，不做，不吃”，樹立東華家風，“先信教，後愛國，先學佛，先出家”，秉承“上求佛道，下化眾生；“道德模範，聖人品行”的理念嚴格管理寺廟。
僧侶們恪守叢林的條條框框，真正修行的純凈是有口皆碑的，使得東華寺成為全國最具特色的修行中心，吸引了眾多僧人前來學習和請教。
在萬興法師的主持下，東華寺成為韶關最大的佛教文化中心之壹，全市模範宗教活動場所，全省和諧寺廟教堂，翁源縣慈善倡導者。每年向社會捐款數百萬元用於救災助學扶貧，極大地促進了翁源縣經濟文化的健康發展。