三葉草殼頭鞋的外底和側面(非尼龍部分)可以用噴壹點衣領的方法清潔，十幾秒後再用軟牙刷輕輕刷壹下，刷的時間不要太長。
清潔時要註意鞋眼的地方，防止金屬鞋眼褪色導致鞋面更臟。通常透明指甲油可以塗在鞋眼上，防止金屬氧化。
刷完後要及時用溫水或冷水洗掉泡沫，盡量減少化學物質腐蝕鞋子的時間。
清洗後，立即用幹抹布擦去殘留的水。如果有氣墊的話，註意把氣墊周圍的水擦幹凈，以免和水接觸發生壹些化學反應導致開膠。
如果鞋底紋路中夾住的鵝卵石可以用牙簽去除，因為長時間夾住異物會使鞋底紋路變形，在壹定程度上影響鞋子的運動性能。
如果鞋面有開裂的硬傷，註意不要在有裂縫的地方繼續摩擦，這樣會讓傷口更臟，甚至裂縫更大。