1.在學科設置上，北京理工大學設有理、工、管、經、文、哲、軍事學、法學、教育學等9個系，涵蓋理、工、管、人文等多個領域。九州大學設有理、法、工、醫、農、人文、經七個系，涵蓋自然科學、工程技術、醫學、人文社會科學。兩所大學在學科設置和優勢學科上存在壹些差異。
2.在研究方向上，北京理工大學以軍事技術和國防科技為主，在航空航天、機電壹體化、信息工程、材料科學等方面也有較高的研究實力。九州大學在化學、生命科學、環境科學、物理、材料科學等領域學術水平突出。
3.在學術聲譽和國際影響力方面，九州大學在日本名列前茅，在國際上也獲得了壹定的聲譽。它曾入選QS世界前100所大學。北京理工大學在中國享有很高的聲譽，曾入選QS世界500強大學。
需要指出的是，兩所大學的優勢學科、教學方式和培養目標也有所不同。可以根據自己的學習發展需求、興趣愛好和未來職業發展規劃，選擇適合自己的學校和專業。