(1)辦公室(辦公廳)。
負責文電、會議、機要等機關的日常運作；承辦信息、安全、保密、新聞宣傳、信訪和辦公室文件、檔案工作；起草重要文稿；負責制定機關工作的規章制度，組織協調政務公開工作，督促檢查重要工作事項；研究全省住房和城鄉建設發展戰略和重大政策問題，提出政策建議；指導城建檔案、建設檢測和代理後勤服務；負責本辦公室的外事工作。制定行政審批制度；負責本辦公室建設行政許可項目的歸口管理；負責省內外建築業企業的備案登記；負責全省建設行政審批咨詢工作。
(2)人事教育司。
承辦機關及直屬事業單位的人事、勞資和機構編制管理工作；制定全省住房和城鄉建設行業教育培訓規劃和年度計劃並組織實施，指導和管理全省住房和城鄉建設行業職工培訓和繼續教育工作；承擔全省住房和城鄉建設行業專業技術職稱評審和專業技術人員資格管理工作；組織協調全省住房和城鄉建設行業職業技能崗位培訓並提供業務指導；組織制定全省住房和城鄉建設行業各類專業技術人員和技術工人的管理辦法並監督實施；負責制定全省住房和城鄉建設行業人才發展規劃並組織實施。
(3)法律部。
組織起草全省住房和城鄉建設地方性法規草案；承擔相關規範性文件的合法性審核；指導全省住房和城鄉建設普法、行政執法、行政執法監督、行政復議和行政訴訟工作；承辦本機關的行政復議和行政訴訟。
(4)住房改革發展司。
制定適合本省的住房政策；指導全省住房建設和住房制度改革；會同有關部門制定全省城鎮住房制度改革的綜合配套政策；組織編制全省住房建設規劃和年度計劃並指導實施。
(5)住房保障辦公室。
擬定全省住房保障政策並指導實施；承辦國家和省廉租住房建設資金和補貼資金安排的有關事項；組織編制全省住房保障發展規劃和年度計劃並監督實施。
(6)城鄉規劃辦公室。
制定全省城鎮發展戰略，制定城鎮化和城鄉壹體化發展目標和措施，制定城鄉規劃和文化遺產保護規劃政策，組織編制全省城鎮體系規劃並監督實施，指導編制城鄉規劃並監督實施。承擔省政府交辦的城市總體規劃和城鎮體系規劃的審批和實施監督工作；負責開發區(工業區)規劃的審查、審批和監督實施；負責歷史文化名城(街區)的保護、監督和管理；指導城市勘測、市政工程勘察、城市地下空間開發利用和城市雕塑；國家和省審批、核準的建設項目選址意見書；負責城鄉規劃單位的資質管理。
(7)標準定額辦公室。
組織制定全省公共服務設施(不含通信設施)的地方標準、經濟定額、建設項目評價方法、經濟參數和建設標準、建設工期定額、建設標準；制定全省工程造價管理的規章制度並監督實施；指導和監督全省各類工程建設標準和定額的執行；負責發布省內人工、材料、機械等費用的調整系數；負責全省工程造價咨詢單位的資質管理。
(八)房地產市場監管部門。
承擔全省房地產市場的監督管理工作；擬定全省房地產市場監管和穩定房價的政策措施並監督實施；指導全省城鎮土地使用權有償出讓和開發利用；擬定全省房地產業的發展規劃、產業政策和規章制度；負責全省房地產開發企業、物業服務企業和房屋中介機構的資質管理；組織全省房屋權屬信息系統的建設和管理。
(九)建設和勘察設計市場監管部門。
制定並監督實施規範全省建築市場各方主體行為、房屋和市政工程項目招標投標、施工許可、房屋建築內外裝修、建設監理、合同管理和工程風險管理的規章制度；擬訂全省工程建設、建築業和勘察設計發展的政策、法規和規章並監督實施；指導全省建築企業參與國際工程承包和建築勞務合作；負責全省施工許可證的審批；負責全省工程擔保管理工作，負責建築業勞動保險相關工作；負責全省建築施工企業、建築安裝企業、建築裝飾企業、建築制品企業、工程監理單位、勘察設計咨詢單位的資質管理，認定從事全省各類工程建設項目招標代理業務的招標代理機構的資質。
(10)城建部門。
擬定全省城市建設和市政公用事業的發展戰略、中長期規劃、改革措施和法規；指導全省城市供水、節水、排水、垃圾處理、供氣、供熱、城市道路和綜合交通設施建設、城市照明、園林、市容和環境管理、城建監察等工作。；指導城鎮汙水處理設施和管網建設；指導城市規劃區的綠化工作。指導全省市政公用設施的建設、運營、安全和應急管理工作。負責全省風景名勝區的規劃審批和保護、利用、建設的監督管理；指導全省城市規劃區的生物多樣性工作，指導全省城市規劃區地下水的開發、利用和保護，參與全省城市防洪的相關工作；參與省內城市建設項目和市政公用事業建設項目可行性研究報告的審查；參與制定省城市建設專項資金的使用計劃；參與省內大中型城市建設項目和市政公用設施建設項目的竣工驗收；承擔全省風景名勝區、世界自然遺產項目和世界自然文化雙遺產項目的相關工作。
(11)村鎮建設辦公室(亞行貸款山西省小城鎮建設項目辦公室)。
擬訂全省村莊和小城鎮發展戰略以及鎮、鄉、村莊規劃、建設和管理的政策、法規和規章並指導實施；指導和監督全省縣級村莊體系規劃和鎮、鄉、村規劃的制定和實施；指導和管理全省鄉村建設的技術服務、標準設計和通用設計推廣工作；指導全省農村住房建設、住房安全和危房改造工作；組織和指導全省村莊和集鎮建設試點工作；指導村鎮人居環境改善和全省重點鎮建設；指導全省災區村鎮重建和大型建設項目區遷建工作；指導全省鄉鎮產權管理和產權登記工作；指導全省村鎮規劃區的基礎設施建設和村容鎮貌管理工作；對全省進城落戶農民提出住房政策建議；承擔全省歷史文化名鎮名村的保護、監督和管理工作。
(十二)工程質量安全監督處(工程建設地震辦公室)。
擬訂全省建設工程質量、建設安全生產和建設工程竣工驗收的政策、法規和規章並監督實施；組織或參與全省重大質量安全事故的調查處理；組織制定全省建築業和工程勘察設計咨詢業的技術政策並監督實施；組織全省工程建設標準設計的編制、審批和推廣；組織編制全省城鄉建設防災減災規劃並監督實施；制定全省各類建築及其附屬設施和城市市政設施建設工程的抗震設計規範；制定全省施工圖設計審查管理辦法並監督實施；負責全省工程竣工驗收備案；指導和監督房屋市政工程的施工現場管理、工程質量和勞動安全；負責建築工業產品進入施工現場的監督管理；承擔建築業人身意外傷害保險的管理工作。
(13)建築節能與科技司。
制定全省建築節能政策和發展規劃並監督實施；負責以節能為主要內容的建築行業新產品、新技術、新設備的推廣應用；組織實施重大建築節能工程。指導全省住宅墻體材料革新工作，負責新型墻體材料使用管理；組織擬訂全省住房和城鄉建設行業科技發展規劃和經濟政策；組織重大科技項目的研究開發；組織全省住房和城鄉建設行業科技成果、新技術、新材料、新產品的研究、開發和鑒定；組織實施省內國際科技合作項目和引進項目創新；管理全省科技成果，指導科技成果轉化和推廣；負責全省進入住房和城鄉建設行業的建築材料、設備和產品的檢測、鑒定和推廣管理工作。
(十四)住房公積金監管部。
制定全省住房公積金政策和發展規劃並組織實施；制定全省住房公積金的繳存、使用、管理和監督制度；監督全省住房公積金和其他住房資金的管理、使用和安全；管理全省住房公積金信息系統。
(15)計劃財務部。
組織編制全省住房和城鄉建設中長期發展規劃和年度計劃；參與研究本省建設領域的財稅價格政策；組織編制全省行業技術引進計劃；參與全省城市基礎設施項目可行性研究報告的審查並負責項目審批和核準，指導全省城市基礎設施建設項目的實施；負責審批全省年度城市建設計劃和住房發展計劃；負責發放本辦公室管理的各類專項建設資金；指導和管理全省對外經濟技術合作和招商引資工作；負責管理全省工業經濟信息統計，並進行經濟分析；負責機關各種資金和國有資產以及本系統行政事業性收費的管理，指導和監督直屬單位財務和國有資產管理及工業經濟活動的內部審計。
省重點工程建設辦公室。
組織制定省重點項目管理辦法和重點項目法人責任制管理辦法並監督實施；會同省有關部門，提出年度重點項目；參與省內重點項目的可行性研究等建設前期工作；參與省內重點項目的竣工驗收並監督招投標工作；協調解決省重點項目建設中的重大問題。
機關黨委負責本部門、機關和直屬單位的黨群工作。
離退休人員辦公室負責機關離退休人員的管理和服務，指導直屬單位離退休人員的管理和服務。
紀檢監察機構執行晉辦發〔2005〕17號文件(4名行政工作人員已移交省紀委統壹管理)。