柯橋區有273座山丘* * *和24座已測量海拔的山丘，分別是吳百剛、木窩尖、杜子建、華山、東幹山、秦王山、西關山和香爐峰，海拔壹般在300-400米之間。羅家尖海拔747米，是中國最高峰。
會稽山:原名茅山，又名木山，是中國名鎮名山之壹，是中國五大名鎮中的南鎮。位於浙江省中東部，西南-東北，主脈在紹興地區的紹興縣、諸暨市、嵊州市、新昌縣、東陽市。它的山脈東西長約100公裏，主峰高700米。
吳百剛:位於柯橋區王灘鎮，屬浙中會稽山系，海拔692米，為江南罕見的火山地貌。該山由安山巖構成，在噴出巖石構成的高臺上分布著許多火山錐，其中以主峰母鵝丘(660米)和公鵝丘(637米)最為典型。
秦王山:在紹興東南20公裏左右。據《輿地廣記》記載:“秦王山就在周城以南，是多峰之極。皇帝第壹次爬上它看東海”，因此得名。《水經註》記載“秦始皇登會稽山，石刻猶在山邊”。這座山就是秦王山。海拔500多米，周圍山巒起伏，許多河流小溪都發源於此。
香爐峰:又名萬偉山、磚石山、玉山，又名天柱山，與大禹墓所在的會稽山相連。相傳山上有壹本《金竹玉言書》，是於霞為了“知山川之物理情”而出版的，最終控制了洪水。香爐峰高354米，峰頂數十米見方。它看起來像壹個香爐，因此得名。它是壹個既有佛教寺廟又有風景名勝的旅遊勝地。
發源於惠濟山南部的謝石河、傅生河、贊公河、平水河(若水溪)、直羅河、南池江、坡塘河、婁公河、李竹江、秋湖河、李湘河、星塘河、莫屋河、下蘆河等10多條河流和溪流，歷史上被稱為鑒湖36源。實際上有43條。向北流入北部平原，與浙東運河、鑒湖、西小江相交，或溢為河，或成湖，或成沼、池、蕩，形成河湖星羅棋布的平原河湖網，其中18個湖泊星羅棋布，有瓜渚湖、何家池湖、白塔洋湖、唐智湖、大板洞湖等。
西小江:又名前清江，原是宋明間的潮汐河流，多次成為浦陽江下遊的主幹道，直通杭州灣。明朝宣德年間(1426~1435)，流放故道，入富春江。西小江成了自成體系。其上遊為進化溪(古稱麻溪，今蕭山)，發源於思靈，經龔燕大橋進入紹興縣江橋上盤。經楊循大橋後，在錢清鎮過浙東運河，轉向東北，經南錢清、新店、管叔、華社、嘉惠、邊霞橋湖，在河湖與直羅河匯合，經三江閘，進入新三江閘幹流，匯入曹娥江入海。境內河流總長58公裏。
浙東運河:古稱漕渠，又名西興運河，開鑿於金代賀勛。西起蕭山西興，東至上虞曹娥。跨越曹娥江，經梁湖、巴特與姚江、邕江匯合，全長約78.5公裏，與杭紹甬公路、肖勇鐵路平行。境內西起錢清鎮，經柯橋，入市區西國門，出京城泗門，東至高埗、閆濤，經京口入上虞，全長41公裏，是蕭山、上虞通往余姚的主要水路。
境內有20條河流縱橫交錯:
謝石發源於傅生鎮謝石村後青山，經上虞東入運河，主流長6.3公裏。
傅生河發源於高埗鎮青龍山，經傅生鎮流入運河，幹流長9.4公裏。
臧公河發源於傅生鎮吳鳳嶺，經上江流入運河，全長5.5公裏。
平水河，又名若水溪，發源於平水鎮茂源嶺，經上竈，於雞山門匯入環城河，全長23.55公裏。
南池江發源於平水妃子嶺，在南門匯入環城河。主流長6.7公裏。
發源於平水妃子嶺的坡塘河在20畝處匯入環城河。主流總長4.1 km。
婁公河，又名蘭亭河，發源於蘭亭鎮大青山，在側門與鑒湖河匯合。主流總長21.55 km。
朱莉河發源於棠棣泰山，在中沿匯入鑒湖河。主流長20.4公裏。
香梨江，發源於舟山冷水灣港，在銅山西側匯入鑒湖河。主流長4.7公裏。
興唐河，發源於湖塘九嶺腳下，流出壽生碼頭，匯入鑒湖河。主流全長18.65公裏。
秋湖河，發源於福泉鎮豆腐尖，在銅山東側。主流長6.6公裏。
莫屋河，源於湖塘“莫屋”二字，在跨湖西橋匯入鑒湖河。主流長6.75公裏。
發源於湖塘涼帽尖的夏綠江，在江橋前與西小江相接。
奚曉江，又名錢清江。發源於蕭山進化溪，經江橋、楊循大橋、錢清，跨越浙東運河，在河湖匯入直羅河，在新三江閘主河道匯入曹娥江。領土長58公裏。
直入河道，從若爾蓋西到北部平原，是山會平原的南北幹渠，與西小江匯合，進入新三江閘主河道。全長14.2公裏。
曹娥江，發源於東陽市雞公嶺，經新昌縣、嵊州市、上虞區，在紹興市越城區孫端鎮橫湖村入三江口入錢塘江。主流全長193公裏，國內主流長度26.3公裏。
濮陽河多次變遷、改道。1950從蕭山上阪入境，名為前清江(西小江)，是蕭山與紹興的界河，全長8.4公裏。
曹娥江中遊最大的支流小順江，發源於嵊縣竹溪赤藤崗，進入五間頭，在上虞區上岸，註入曹娥江。主流全長72公裏，境內17.6公裏。