福清火車站開通多個公交班次直達福清市區、各個鄉鎮、平潭自貿區。旅客若想去福建自貿區江陰片區、融僑經濟開發區、元洪投資區、石竹山、閩臺（福州）藍色經濟產業園區，則需到福清市區的公交南站(水南車站)、龍山車站、西門車站或沃爾瑪公交站轉車。由於公交車次較密集，旅客只需耐心等待，無須乘坐票價頗高的私人小車，既沒有安全保障，價格又貴。
已開通公交車次有：808，806，901,822,832路。晚間可以乘坐832路公交車來往市區和火車站，該線路環繞福清城區主要街道，方便夜晚到達福清火車站的旅客。
福清火車站距離城區比較近，乘坐公交是最方便實惠的選擇，只需10~15分鐘左右便可抵達福清城區。
（友情提示：1. 雖然公交停靠站看似停靠很多站，但其實前面幾站較少旅客上下車，壹般都是不停靠的，所以實際停靠站少很多。2.所有的公交路線都經過福清公交南站（水南車站），水南車站是目前福清規模最大的汽車站，亦有很多公交車次來往市區以及各鄉鎮，所以對於那些不清楚要哪壹站下車的旅客，建議可以選擇乘坐任意壹趟公交路線，到達水南車站後下車轉乘公交到達目的地）
公交車站位於火車站站前廣場的左側，旅客只需憑招牌指示步行約壹分鐘即可到達。 808路 (福清火車站—龍山車場/元洪中學）
運行時間:06:15-18:00(夏) 06:30-18:00(冬)。
票價1元。
途經公交南站、東門、體育公園、龍山車站、元洪中學等。要去街心公園、壹拂街、後埔街、市政府附近的旅客，可從新華書店或者東門站下車步行過去只需5分鐘左右。旅客也可從龍山車站換乘巴士前往海口鎮、城頭鎮、彌勒巖（瑞巖山）風景區、
元洪投資區、松下鎮、元洪碼頭。（詳細停靠站點如右圖所示）
備註：該車次會針對火車站時刻表到站時間來接客，所以壹般旅客出站後便有班次乘坐。不過從龍山車場出發的旅客要註意，因線路隔班發往三個終點站，所以往龍山車場方向班次可能會有壹定程度晚點。乘坐本線路的乘客請註意辨識車頭牌或向駕駛員詢問本車目的地，以免誤乘。因新能源車在龍山車場存在調頭困難的問題，因此車輛在行經龍山車場後將繼續延伸壹站至元洪中學站。
806路（福清火車站—宏路街道/融深工業園） 夏首末車時間:06:15-19:00
冬首末車時間:06:30-18:40
途經主要站點：福建師大、公交南站、西門車場、沃爾瑪、瑞鑫大酒店、萬達廣場、融僑城、冠捷電子廠、宏路街道
備註：該線路經過福清最主要的街道清昌大道，清昌大道遍布酒店、各類餐飲、住宿以及眾多金融機構銀行，多數外來旅客多會選擇在清昌大道靠近沃爾瑪和萬達附近住宿，因為該線路頗受外地旅客的歡迎。乘坐融深工業園專線請辨識車頭牌乘坐或咨詢駕駛員。
822路公交線路(福清高速公路口—福清火車站 )
首末車時間:06:15-19:00，終點站高速公路口。
票價1元。
途徑水南車站（公交南站）、玉融公園（五馬山）、陽光錦城、兩館壹中心等。（詳細停靠站點如右圖所示）
備註：線路班次間隔60分鐘或更長，趕時間的乘客建議轉乘其他線路出行。
901路公交線路(福清火車站—琯口農職院 )
運行時間：福清火車站6:00-19:00(夏)6:30-18:30(冬)|琯口農職院6:00-19:00(夏)6:30-18:30(冬)
全程票價：分段計費，全程3元
該線路從始發站福清火車站，經福建師大福清分校、公交南站（水南車站）、濱江中學、龍江公園、富貴世家、中聯城、美嘉城、宏路環島、宏路車站、美佛爾學校、上杭路口（福耀玻璃）、鏡洋鎮，至倌口農職院終點站，每12分鐘壹。（詳細站點如右圖）
福清832路夜間公交線路(沃爾瑪—福清火車站 )
運行時間：福清沃爾瑪超市19：00-20:30(夏)18：40-20:30(冬)|福清火車站19：00-22:40(夏)18：40-22:40(冬)
票價信息：票價1元
832路（晚間公交線路），***投入10輛車循環運營。沿途所經站點有：福清沃爾瑪、西門車場、西聖公園、清航街、福清醫院、福清二中、後埔街、街心公園、佳源超市、湖濱霞、公交南站、福清第二實驗小學、下梧村、福建師大福清分校、音西中學、融強醫院、霞樓、祥興集團、康居建材市場、東南大道北、東南大道中、東南大道南、迎賓大道東、迎賓大道西、火車站。
福清火車站也有前往平潭綜合實驗區的大巴，是前往平潭最便捷優惠的方式。福清火車站至平潭，最早06:00，最晚18:00，每20分鐘壹班車。歷時1小時多壹點，途經高山、東瀚鎮。
前往龍田、港頭、三山、高山、東瀚的旅客可到水南車站轉車，或者在路口（祥興集團）等公交。
前往漁溪、新厝、江陰自貿區、天生農莊的旅客則需要在水南車站、西門車站或者沃爾瑪車站轉車。前往石竹山、壹都漂流（東方第壹漂）、靈石山森林公園、南少林的旅客，可乘坐任意公交車，並在公交南站（水南車站）下車，再轉乘其他班車前往。
比如去石竹山：
方法壹：隨便哪壹路公交車坐到公交南站，轉801A（車頭插石竹山牌子）終點站下車，壹***4元。
方法二：
1、從福清火車站乘坐福清808、822、901、806路到達融強醫院站
2、乘坐福清801路（右圖）到達終點站石竹山站
去壹都漂流的旅客可以乘坐806在西門車場下車換乘壹都漂流的班車。
去瑞巖山風景區（彌勒巖）的旅客可以乘坐808到終點站龍山車場或元洪中學下車，然後轉乘前往海口、城頭、松下或五龍的巴士和售票員說在彌勒巖下車提醒壹下。