武當山是明朝永樂年間大修時的大本營。明朝時，部隊經常在此紮營，嘉靖三十壹年(1552)重修。原為五進三路的院落，共有房間2200余間，包括龍虎殿、齊殿、殿、小觀殿等壹系列殿堂、祠廟、壇燈。臺前臺後疊，規條嚴整，左右院落厚重，城樓相鄰，玉帶河交織。巍峨的竹墻環繞，環衛宮神秘莫測。其規制之宏偉，與北京太和門太和殿的風格相似。“玉虛如秦阿芳”，可見玉虛宮當年是多麽的宏偉。清乾隆十年(1745)，大部分建築被毀。現存的建築只有宏偉的宮墻和城門。宮墻堅如月圍仙闕，宮門為須彌石臺雕瓊花，券拱三孔。兩翼八字墻鑲嵌琉璃瓊花圖案。門前是裝飾柱的臺階，朱碧富麗堂皇。宮殿入口是壹個占地40多畝的大院子，青磚鋪就，開闊雅致；跨過戴宇河，便是第二宮門，龍虎殿、朝拜殿、正殿、父母殿等遺跡被拱起在高高的平臺上。宮墻以東是東宮，又稱東道研究所，有磚房、浴場、廚房、龍井等遺址；宮墻以西是西宮，預計有仙臺、水簾洞、禦花園、兀顏姓廳等遺址。宮門內外有四座石亭，相對而立。在亭子裏，有巨大的石碑(傳說中的龍王六子)。宮門內兩座石亭中的石碑高6米，寬2.35米，厚0.76米。身高9.03米，體重各達到100噸以上。這兩個銘文分別是:第壹，永樂十壹年(1413)是武當山保護道教的“聖旨”；壹、永樂十六年(1418)大嶽太和山、山路宮刻碑。宮門外有兩座石亭，其中壹座刻有嘉靖三十壹年(1552)太和山宮重修碑。四個銘文雋永渾圓，銘文浮雕龍紋，剛健舞動，造型穩重渾厚。甲殼和肌肉部分紋理明顯不同，腿腳承受運動的重量，尾巴卷成壹盤，像壹座高大的帝國紀念碑。武當山上有十二塊巨大的石碑，是國內外罕見的石刻，極其珍貴。
永樂十六年刻的碑文中，明成祖永樂皇帝引用道教經典描述“真武大帝”與武當山的關系，聲稱其父朱元璋及其在世間的成就都得到了真武神的幫助，所以在武當山建宮觀，以表彰其神通，報答其恩。嘉靖三十二年的碑文，追溯了他的祖先永樂皇帝修建武當山的功績。他在碑文中寫道:“兩百年來，人民國家富強，近龍三王。雖然齊國和齊國的數量不壹樣，但是邊塞還是受到了輕微的沖擊和破壞。高達耿武，妳是大漢奸，可以用。”認為這是上帝的祝福。於是不惜重金重建武當。
明朝永樂年間，國家北建紫禁城，南建武當，在武當山修建了規模宏大的皇家寺廟，玉虛宮是整個建築群中最大的寺廟。明代著名文學家王世貞不禁驚呼“玉如秦室”。