公租房租金收入納入重慶財政基金預算管理，按照政府非稅收入有關規定繳入市級國庫。市財政局統壹開設“租金匯繳結算賬戶”，專門用於公***租賃住房租金的匯總和解繳。並要求執收單位在當日內將收取的公***租賃住房租金全額繳入“匯繳結算賬戶”。
(壹)可以申請減免的情況：
公租房月標準租金支出超過上壹年家庭月平均收入9%的部分，可申請減免。
(二)不予減免的情況：
住房建築面積超過面積控制標準的，超標增收租金不予減免。
(三)全部減免的情況：
1、享受離休待遇的幹部或已故離休幹部配偶的住房(按離休幹部或已故離休幹部配偶本人戶口所在地)，提租後新增租金全部減免。
2、烈屬、因公犧牲軍人家屬，特等、壹等傷殘軍人或特等、壹等傷殘軍人配偶的住房，在上壹年實付租金的基礎上，增租部分全部減免。
3、民政部門確認的家庭人均收入低於城市居民最低生活保障標準的，在上壹年實付租金基礎上，增租部分全部減免。