軍校校址原計劃設在東北、北京等地。經過反復實地調查和科學論證，考慮到建國之初財政困難，抗美援朝戰爭爆發，就業迫切。
為了省錢和爭取時間，最終選擇了原華東軍南京總部。現成的房子位於南京紫金山腳下，原是國民黨政府國防部和中央軍政學校的大院，面積廣闊，環境幽靜，居住條件優越。
南京軍事學院的教學方針:
軍校教學工作以馬列主義、毛澤東思想為指導，以中央軍委制定的戰略方針為依據，研究外軍戰略思想和作戰特點，探討人民戰爭的指導規律、軍隊現代化和現代條件下作戰的組織指揮。
學生主要學習哲學、政治經濟學、社會主義建設、黨史、外交政策、戰爭與戰略理論、兵役、先進兵團戰術、戰史、現代科技知識等。
在教學中貫徹理論與實踐相結合、教學與科研相結合的原則。教學方法主要是研究。軍事教學計劃是學習理論、研究戰例、進行沙盤、地圖、野外工作和總部演習。
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