1、單位每月發放工資時預扣稅款並辦理扣除；
2、個人向匯繳地主管稅務機關辦理匯算清繳申報時進行扣除；
3、直轄市、省會城市、計劃單列市及其他城市，按每月1500元扣除；
4、市轄區戶籍人口超過100萬的城市，按每月1100元扣除；
5、市轄區戶籍人口不超過100萬的城市，按每月800元扣除。
個人所得稅的計算方法：
1、確定納稅人的綜合所得或分類所得；
2、扣除各項免稅收入、減免稅額、基本扣除額等；
3、按照適用的稅率計算應納稅額；
4、減去已預繳的稅額，得出應補（退）的稅額。
綜上所述，個人所得稅專項扣除租房可通過單位預扣稅款、個人匯算清繳申報進行，扣除標準依據城市規模不同而異，直轄市等大城市每月1500元，市轄區戶籍人口超過100萬的城市1100元，不超過100萬的城市800元。
法律依據：
《個人所得稅專項附加扣除暫行辦法》
第二十五條
納稅人首次享受專項附加扣除，應當將專項附加扣除相關信息提交扣繳義務人或者稅務機關，扣繳義務人應當及時將相關信息報送稅務機關，納稅人對所提交信息的真實性、準確性、完整性負責。專項附加扣除信息發生變化的，納稅人應當及時向扣繳義務人或者稅務機關提供相關信息。前款所稱專項附加扣除相關信息，包括納稅人本人、配偶、子女、被贍養人等個人身份信息，以及國務院稅務主管部門規定的其他與專項附加扣除相關的信息。本辦法規定納稅人需要留存備查的相關資料應當留存五年。