根據《中華人民共和國房產稅暫行條例》第二條規定，房產稅由房產所有人繳納。產權不確定的，由財產保管人或者實際使用人支付。妳單位所建廠房雖未辦理房產證，未取得產權，但屬於房產實際使用人。所以房產稅應該照章繳納。
收取的租賃費肯定是收入，營業稅也要交。