劃撥土地使用權可以依法抵押、出租，但與土地使用權轉讓相比，國家對劃撥土地使用權進入二、三級市場有嚴格限制，禁止利用劃撥土地使用權進行經營活動。究其根源，主要是劃撥土地使用權是無償取得的，國家權益沒有得到彰顯。劃撥土地使用權價格中加入出讓金的，應當等於出讓土地使用權價格。在此理論基礎上，可采用以下方法計算劃撥土地使用權價格:
1，成本法。采用成本法計算土地出讓價格時，土地價格為土地成本價與土地增值收益之和。其中，土地增值收益來自“增值租金”，應歸國家所有，相當於出讓金。土地成本價是土地使用者在取得土地使用權時所支付的平均成本。因此，劃撥土地使用權的價格應為土地成本價，包括土地購置費、土地開發費、相關稅費、利息和利潤。
2.收入減少法。收益還原法是在估算土地未來年收益的基礎上，以壹定的還原利率將土地的預期年收益轉化為評估期的日總收益的方法。目前《城市土地估價條例》對如何計算土地凈收益的計算方法沒有明確規定。因此，可以通過調查與待估土地屬於同壹區域的國有企業的租賃租金水平來間接推算。國有土地租賃水平由土地出讓金水平決定，是國家權益在土地收益中的體現。因此，從土地凈收益中減去國有土地租賃租金，可以得到劃撥土地的凈收益。然後通過區域因素和個體因素的比較和修正，得出待估劃撥土地的凈收益。劃撥土地使用權的最終價格等於劃撥土地的凈收益除以土地恢復利率。
3.市場比較法。可以預見，隨著企業對劃撥土地興趣的增加和劃撥土地使用權抵押、轉讓的增多，劃撥土地交易案件也將逐年增加。通過劃撥土地的交易案例，修正交易情況、日期、區域和個人因素，得到待估劃撥土地使用權的價格。
4、隨土地使用權轉讓扣除間接計算的轉讓費。現在很多地方通常是按照評估地價的壹定比例收取土地出讓金，出讓金相對固定。從出讓土地使用權價格=劃撥土地使用權價格+土地使用權出讓金的公式可以得出:
劃撥土地使用權價格=出讓土地使用權價格×(1-租賃比率)
5.綜合法。即從當地征地成本、當地收入、土地市場的健全完善程度、政府確定的土地出讓金比例等多方面綜合考慮影響劃撥土地使用權價格的因素。采用上述四種評估方法，經過綜合分析，剔除不適當的計算方法，對合理的計算結果進行算術平均或加權平均，得出劃撥土地使用權價格。