生產性生物資產折舊是指在生產性生物資產的使用壽命內，按照壹定的方法對折舊額進行系統的分配。其中，應計折舊是指生產性生物資產的原價扣除預計凈殘值後應計提折舊的余額；如果已計提減值準備，還應扣除生產性生物資產減值準備的累計金額。預計凈殘值是指生產性生物資產預計使用壽命期末處置收入扣除處置費用後的余額。
1.應計提折舊的生產性生物資產範圍
當期增加的成熟的生產性生物資產應當計提折舊。已提足折舊的，無論能否繼續使用，都不再計提折舊。需要註意的是，融資租賃租出的生產性生物資產和經營租賃租出的生產性生物資產應當計提折舊；融資租賃租出的生產性生物資產和經營租賃租出的生產性生物資產不計提折舊。
2.生產性生物資產的預計使用壽命
企業在確定生產性生物資產的使用壽命時，應當考慮以下因素:(1)資產的預期產出能力或者實物產出；(2)資產的預期有形損失，如牲畜老化、經濟林老化等。；(3)資產的預期無形損失，如現有生產性生物資產的產出能力和產出農產品的質量因新品種的出現而相對下降，生產性生物資產產出的農產品因市場需求變化而相對陳舊等。
在實踐中，企業應在考慮這些因素的基礎上，結合不同生產性生物資產的具體情況做出判斷。例如，在考慮林木生產性生物資產的使用壽命時，他們可以考慮溫度、濕度和降雨量、灌溉特性、嫁接和修剪程序、植物種類和分類、植物間距、所用主根類型、采摘或收獲方法以及所生產產品的預期市場需求等生物特性。在同壹環境下，同壹生產性生物資產的預計使用壽命應當基本相同。
3.生產性生物資產折舊方法
生物資產準則規定，企業可以選擇的折舊方法有壽命平均法、工作量法和產量法。在具體應用中，企業應根據生產性生物資產的具體情況，合理選擇相應的折舊方法。
4.合理確定生產性生物資產的使用壽命、預計凈殘值和折舊方法。
企業應當根據生產性生物資產的類別，結合本企業的具體情況，制定適合本企業的生產性生物資產目錄和分類方法。對於達到預定經營目的的生產性生物資產，應當根據相關經濟利益的性質、用途和預計實現方式，合理確定生產性生物資產的使用壽命、預計凈殘值和折舊方法，作為生產性生物資產核算的基礎。