不可抵扣進項稅的處理:企業決定轉為小規模納稅人的，其不可抵扣的進項稅轉出，不能退稅。所以在轉為小規模納稅人之前，要及時進行發票認證，保證銷項稅全額抵扣進項稅，否則現金流會流失，成本會增加，利潤會減少。
小升級後，企業面臨更多的監管，需要提交更多的報告，這將導致更多的支出和融資環境約束，客觀上影響“小升級”的積極性。
統計:“小升級”後，企業需要上報月報(工業產銷產值和產品產量報表、財務狀況報表)、季報(工業主要產品庫存報表、勞動工資報表、景氣調查問卷)和年報(基本情況報表、財務狀況報表、年度產能報表、信息報表等)。17報表)，客觀上增加了企業數量。《中華人民共和國公司法》第三條公司是企業法人，擁有獨立的法人財產，享有法人財產權。公司以其全部財產對其債務承擔責任。
有限責任公司的股東以其認繳的出資額為限對公司承擔責任；股份有限公司的股東以其認購的股份為限對公司承擔責任。