菏澤職業學院是經山東省人民政府批準，教育部備案的公辦全日制普通高等學校。學院堅持高端規劃、高點定位、內涵發展、特色發展，努力打造紮根菏澤、符合國際標準、具有中國風格、形成優勢品牌的魯蘇豫皖邊區壹流高職院校。
學院下設貿易與物流系、機電工程系、交通工程系、信息工程系、經濟管理系、食品科學與化學工程系、建築工程系、旅遊管理系、老兵教育學院、國際交流學院、創新創業學院***11系。有電子商務、物流管理、會計學、互聯網金融、機電壹體化技術、工業機器人技術、光伏發電技術及應用、電氣自動化技術、電源技術、計算機應用技術、物聯網技術、動漫制作技術、汽車檢測與維修技術、新能源汽車技術、汽車營銷與服務、應用化學技術、精細化工技術、食品生物技術、建築工程技術、建築裝飾工程技術，有工程造價、旅遊管理、空乘、音樂表演、動物醫學、 公共事務管理、兒童發展與健康管理，學院擁有山東省高等職業教育兩個品牌專業群——電子商務物流專業群和人工智能專業群； 山東省高職教育有6個重點專業——電子商務、物流管理、物聯網技術、機電壹體化、電氣自動化、工業機器人。