上海交通大學船舶與海洋工程系創建於1943，有著悠久而輝煌的歷史。
作為我國船舶與海洋工程高等教育和科研的源頭，培養了第壹個萬噸級船舶輪機長、第壹個核潛艇輪機長、第壹個航母輪機長、第壹個7000米載人潛水器輪機長、第壹個3500米無人遙控潛水器輪機長等壹大批技術專家、管理骨幹和領導幹部，在人才、科研、試驗技術等方面為行業提供了全方位的支持。歷屆全國學科評估排名第壹，2012最新學科評估排名第壹。
擁有船舶與海洋工程國家壹級重點學科。1981船舶設計與制造、船舶流體力學、船舶結構力學首批獲國家博士學位。1985，首批通過海洋工程國家重點實驗室驗收。1988，船舶流體力學和船舶結構力學被評為第壹批國家重點學科。2006年通過船舶與海洋工程國家實驗室認可。
涵蓋船舶與海洋結構物設計與制造、海洋工程、水聲工程三個二級學科，形成船舶與海洋工程重大力學問題、新船型與現代造船技術開發設計、海洋工程裝備關鍵技術、水下作業檢測技術與裝備、先進實驗技術五個優勢學科。