首先，農村土地分為農用地、建設用地和未利用地。這三個用途不能隨便改。如果房屋和工廠建在農業用地上，它們就是非法的。這是我國土地管理法明確規定的。如果村委會租給妳的土地不允許建工廠，妳可以依據民法上的合同相對性原則要求村委會進行補償，但違法建設的性質不會因為有租賃合同，合同上註明可以建工廠而改變。
第二，同理，妳辦了各種手續，合法經營，或者交了很多稅，都不會影響對違章建築的認定。這是兩種不同的邏輯；
第三，妳用土地建工廠，卻沒有土地使用證、建設用地規劃許可證、建設工程規劃許可證等。，直接導致違法用地、違法建設。至於村委會口頭承諾辦理證件，這個信息沒有任何價值；
第四，如果發現妳的建築違法，國家不會對妳進行補償，因為《中華人民共和國賠償法》只保護公民的合法權益，除非在拆遷過程中存在嚴重的違法行為，侵犯了妳的其他合法權益，才會對妳進行補償。
第五，如果拆遷部門在拆遷過程中存在違法行為，可以固定證據，向該部門申請國家賠償。如果該部門不予賠償，可以向同級人民法院提起國家賠償訴訟。
2.如果是合法廠房，通過村民大會與村委會簽訂的租賃合同壹般可以獲得相應的補償，主要包括以下幾個部分:
(1)無法移動的大型機械、生產線等設施的補償。這部分補償對工廠來說應該很重要。生產線和大型機械可以說是壹個工廠的靈魂，大部分機械難以移動或者移動後無法重復使用。這部分賠償通常占整體賠償的很大壹部分，出租方應積極主張。
(2)搬遷費用。廠房裏設施很多，很難搬。補償方通常根據搬遷的難易程度和成本確定壹筆搬遷費補償，通常廠房的搬遷費也是壹筆較大的補償費；