動眼神經核位於中腦上丘水平的導水管周圍的腹側灰質中。來自核的纖維經腹穿過內側縱束、紅核和黑質，在大腦腳的內側離開腦幹，在大腦後動脈和小腦上動脈之間。
在小腦幕遊離邊和固定邊之間的小三角內，穿過蝶鞍後床突附近的硬腦膜，進入海綿竇，位於竇外上角，再經眶上裂分支進入眶內。
擴展數據:
動眼神經的組成
動眼神經核可分為三部分:外側核的主核最大，含有大神經元群，支配上瞼提肌、上直肌、內直肌、下斜肌和下直肌，但支配各眼肌的核的位置及其交叉點尚未明確。
成對的艾維核位於外側核的後內側，由較小的神經元組成，其纖維支配瞳孔括約肌和睫狀肌。外側之間還有壹個內側核。艾維核和內側核都屬於副交感神經系統。動眼神經通過這些核團參與壹些瞳孔反射活動。