房東在租約到期後扣除清潔費是否合理要視情況而定。如果租賃合同中明確了租賃期滿後房屋交付的要求，而租客達不到要求，房東扣除清潔費是合理的。而如果租賃合同中沒有明確規定，租客在交房時也沒有把房子搞得亂七八糟，房東扣除清潔費是不合理的。