領導商務部全面工作，分管人事部。
高虎城的國際貿易談判代表(正部長)、副部長(兼):
分管辦公廳、歐洲部、機關黨委、老幹部局、中歐協會。
姜增偉副部長:
分管市場秩序部、商務服務部、臺港澳部、機關服務局、兩岸經貿交流協會。
鐘山副部長兼國際貿易談判副代表:
分管財務部、外貿部、公平貿易局、許可證局、外貿中心、會計學院、聯系貿易審計局、主辦行業調查局、外貿發展局、紡織商會、企業協會、貨代協會。
蔣副部長:
分管行業司、信息司、出版社總社、電子商務中心、機電商會。
易小準副部長:
分管政研室、國際部、WTO部、交流中心、國際貿易學會、WTO研究會。
陳建副部長:
分管合作部、亞洲部、承包商協會、咨詢協會、合作學會、跨國公司研究會。
傅自應副部長:
分管綜合部、援外部、西亞非洲部、研究所、培訓中心、統計學會。
王和民紀檢組長:
分管紀檢組、監察局、機關紀委。
重慶國際貿易談判副代表(副部長級):
分管條法司、反壟斷局、特派員辦事處、經濟合作局、駐外經貿機構。
王超副部長:
分管服務貿易司、外資司、美國大學司、投資促進局、輕工商會、五礦商會、外商投資協會、國際投資促進會、服務貿易協會。
侍郎方:
分管市場建設部、市場運營部、流通促進中心。
部長助理邱虹:
分管外事司、地方食品商會、醫保商會。
組織機構商務部內設28個機構，分別是:辦公廳、人事司、政策研究室、綜合司、條約法律司、財務司、市場秩序司、市場體系建設司、商務服務管理司、市場運行調節司(全國繭絲綢協調辦公室)、反壟斷局、對外貿易司、服務貿易司、機電與科技產業司(全國機電產品進出口辦公室)。外資經濟合作司、進出口公平貿易局、產業損害調查局、國際經濟貿易關系司、世界貿易組織司(中國政府世界貿易組織通知咨詢局)、亞洲司、西亞非洲司、歐洲司、美洲大洋洲司、臺港澳司、信息技術司、外交部。
商務部各司(廳、局)主要職能辦公室
主要功能:
負責文電、會議、機要、檔案等機關的日常運作；承辦信息、保密、新聞發布、政務公開、保密等工作；編輯出版《中國對外經濟貿易公報》。
其他事項:
商務部在大連、天津、上海、廣州、深圳、海南、南寧、南京、武漢、青島、鄭州、福州、Xi安、成都、杭州、昆明設有16專員辦，行政編制120。
人事部
主要功能:
承擔機關、直屬單位和海外機構的人事管理、隊伍建設、教育培訓工作。
政策研究室
主要功能:
研究經濟全球化、區域經濟合作、現代市場體系和現代流通方式的發展趨勢，提出對策和建議；研究擴大對外開放、改革國內外貿易流通體制等重大問題並提出意見和建議；研究提出完善現代市場體系的綜合性政策建議。
綜合部
主要功能:
組織制定國內外貿易和國際經濟合作的發展戰略和規劃；監測和分析企業經營情況，研究企業經營和結構調整中的重大問題，提出相關政策建議；承擔相關統計和信息發布工作。
條約法司
主要功能:
起草有關法律、法規和規章草案；就中國經貿法律法規與國際多邊和雙邊經貿條約、協定的銜接提出意見；承擔起草國際經濟貿易公約的有關工作；審核多邊和雙邊經貿條約、協議等談判文件；組織經貿領域知識產權和投資(保護)協定的多邊和雙邊談判；承擔與爭議解決有關的工作；承擔本機關相關規範性文件的合法性審核；承辦相關的行政復議和行政訴訟。
財會部
主要功能:
研究提出與業務工作有關的財政、稅收、金融和價格方面的政策建議；承擔商務部管轄的各類業務經費、專項資金和援外資金的具體使用和管理，編制預決算並下達預算；承擔本部門資產管理、基本建設和內部審計工作。
市場秩序部
主要功能:
帶頭協調整頓和規範市場經濟秩序；推進商務領域信用建設，引導商業信用銷售，建立市場誠信服務平臺；參與組織打擊侵犯知識產權和商業欺詐行為。
市場體系建設司
主要功能:
組織制定和完善規範市場體系的政策；促進流通標準化；牽頭組織和規範零售企業的促銷行為；指導大宗產品批發市場規劃、城市商業網點規劃和商業體系建設；推進農村市場和農產品流通體系建設；按有關規定對拍賣、典當、租賃、汽車流通和舊貨流通行業進行監督管理。
商業服務管理部
主要功能:
承擔商務服務業(含餐飲業、住宿業)的行業管理；推進流通體制改革，發展連鎖經營、商業特許經營、物流配送等現代流通方式；指導社區商業發展、流通領域節能降耗，提出促進中小商業企業發展的政策建議；按照有關規定對成品油流通進行監督管理；引導再生資源回收利用。
市場運行監管司(全國繭絲綢協調辦公室)、
主要功能:
監測分析市場運行、商品供求，調查分析商品價格信息，進行預測預警和信息引導；承擔建立和完善生活必需品市場供應應急管理機制的相關工作；負責重要消費品儲備(肉、糖、邊賣邊茶、小包裝食品等)的管理和市場調節。);承擔酒類流通、生豬屠宰管理、繭絲綢協調等相關工作。
中國反壟斷局
主要功能:
依法對經營者集中行為進行反壟斷審查；指導中國企業應對國外反壟斷訴訟；開展多雙邊競爭政策的國際交流與合作。
其他事項:
商務部承擔《反壟斷法》規定的國務院反壟斷委員會的具體工作。
對外貿易部
主要功能:
制定進出口商品管理辦法和目錄；承擔重要工業品、原材料和重要農產品進出口總量計劃的組織實施；編報進出口商品配額和關稅配額年度計劃並組織實施；制定和實施進出口商品配額招標政策；指導交易會、展銷會等貿易促進活動和對外貿易促進體系建設。
其他事項:
國家發展和改革委員會(NDRC)負責編制重要工業品、原材料和重要農產品進出口總量計劃，商務部負責在NDRC確定的進出口總量計劃內組織實施。糧棉煤由國家發展改革委會同商務部在進出口總量計劃內進行分配，相關政策予以協調。
服務貿易司
主要功能:
牽頭制定服務貿易發展規劃；擬訂技術性貿易政策和促進服務出口的規劃和政策並組織實施；負責技術進出口管理、服務貿易促進和服務貿易統計。
機電工業部(國家機電產品進出口辦公室)
主要功能:
擬訂機電產品和高新技術產品進出口、成套設備出口和加工貿易的管理政策和相關目錄，並組織實施；承辦機電產品和高新技術產品的貿易推廣；擬定進口機電產品招標辦法並組織實施；依法制定和實施國家出口管制政策，簽發兩用物項和技術進出口許可證。
外國投資管理部
主要功能:
擬訂外商投資政策和改革方案並組織實施；研究外商投資情況，報告趨勢和建議；審查外商投資企業的設立及其變更、重大外商投資項目合同章程的重大變更和法律的特別規定；依法監督檢查法律、法規、規章和外商投資企業合同章程的執行情況，協調解決有關問題；指導外商投資企業的招商引資和審批工作，規範外商投資活動；承辦外商投資統計工作；指導國家級經濟技術開發區、蘇州工業園區和邊境經濟合作區的相關工作；會同有關方面制定並組織實施促進服務外包發展的規劃和政策，推進服務外包平臺建設。
對外援助部
主要功能:
制定並組織實施對外援助政策和方案，推進對外援助方式改革；組織對外援助談判，簽署協議，處理政府間援助事務；編制對外援助計劃並組織實施；監督檢查援外項目的實施。
外國投資和經濟合作司
主要功能:
制定和實施對外經濟合作政策；依法管理和監督對外投資、對外承包工程、對外勞務合作、設計咨詢等對外經濟合作業務；制定公民出國就業管理政策；承擔境外勞務人員和境外雇員權益保護的相關工作；審核外商投資設立企業(金融企業除外)和對外經濟合作企業的境內企業經營資格；承擔對外直接投資、對外承包工程和勞務合作的統計工作。
進出口公平貿易局
主要功能:
承辦進出口公平貿易相關工作；調查針對中國出口商品的歧視性貿易政策、法規及其實踐，並進行相關磋商和談判；建立進出口公平貿易預警機制；指導和協調對中國出口商品反傾銷、反補貼和保障措施的應訴及相關工作。
工業損害調查局
主要功能:
承擔產業損害的調查和裁定；建立健全產業損害預警機制，開展產業競爭力調查、產業安全應對和效果評估；指導和協調工業安全反應。
國際經濟貿易關系司
主要功能:
制定和實施多邊和區域經貿政策；根據分工處理與多邊和區域性經貿組織的關系；組織實施自由貿易區戰略；牽頭組織多邊、區域和自貿區對外經濟貿易談判；承辦聯合國和其他國際組織在華經濟技術合作的涉外管理事務；管理對華多雙邊無償援助和贈款(不包括金融合作項下外國政府和國際金融組織對華贈款)。
世界貿易組織司(中國市政府世界貿易組織通知咨詢局)
主要功能:
牽頭組織世界貿易組織框架下的多邊和雙邊談判；承擔世界貿易組織爭端解決機制的工作；履行在世界貿易組織中承擔的貿易和投資政策審議、通報和磋商義務；推進進出口貿易標準化。
亞洲分部
主要功能:
擬訂並組織實施與主管國家(地區)的經貿合作發展戰略、規劃和政策；建立雙邊和區域政府間經貿聯委會、混委會等機制；組織雙邊和區域經貿談判；處理國家(地區)間經貿關系中的重要事務；監督外國政府與中國簽訂經貿協議的履行情況，開展對外談判，幫助中國企業獲得國外市場準入；管理與未建交國家的經貿活動。
西亞和非洲司
主要功能:
擬訂並組織實施與主管國家(地區)的經貿合作發展戰略、規劃和政策；建立雙邊和區域政府間經貿聯委會、混委會等機制；組織雙邊和區域經貿談判；處理國家(地區)間經貿關系中的重要事務；監督外國政府與中國簽訂經貿協議的履行情況，開展對外談判，幫助中國企業獲得國外市場準入；管理與未建交國家的經貿活動。
歐洲分部
主要功能:
擬訂並組織實施與主管國家(地區)的經貿合作發展戰略、規劃和政策；建立雙邊和區域政府間經貿聯委會、混委會等機制；組織雙邊和區域經貿談判；處理國家(地區)間經貿關系中的重要事務；監督外國政府與中國簽訂經貿協議的履行情況，開展對外談判，幫助中國企業獲得國外市場準入；管理與未建交國家的經貿活動。
美國大洋洲局
主要功能:
擬訂並組織實施與主管國家(地區)的經貿合作發展戰略、規劃和政策；建立雙邊和區域政府間經貿聯委會、混委會等機制；組織雙邊和區域經貿談判；處理國家(地區)間經貿關系中的重要事務；監督外國政府與中國簽訂經貿協議的履行情況，開展對外談判，幫助中國企業獲得國外市場準入；管理與未建交國家的經貿活動。
臺港澳司
主要功能:
擬訂和實施對香港、澳門特別行政區和臺灣省的經貿規劃和政策；牽頭組織與香港、澳門特別行政區有關部門和臺灣省授權機構的經貿磋商；會同有關方面，負責內地與香港、澳門特別行政區更緊密經貿關系安排的磋商和實施；協調處理對臺經貿工作中的重大問題，制定對臺直接貿易計劃；牽頭處理多邊和雙邊經貿領域的涉臺問題；管理和指導對臺貿易，協調臺商投資管理。
情報部門
主要功能:
制定利用電子商務開拓國內外市場的相關政策措施；制定商務領域電子商務相關標準和規則；建立和完善商務信息公共服務體系；承擔部電子政務和政府網站的管理工作；組織建設進出口預警、市場運行和商品供求監測系統。
外事司
主要功能:
制定外交部外事工作制度；承擔相關外事工作。
黨委
主要功能:
負責機關、駐各地特派員辦事處和北京直屬單位的黨群工作。
老幹部局
主要功能:
負責機關離退休幹部工作，指導直屬單位離退休幹部工作。