1)噴灑或澆水法:將藥物用清水稀釋到壹定濃度，用噴霧器噴灑在土壤表面，或直接倒入土壤中，使藥液滲透到土壤深層，殺死土壤中的細菌。噴灑農藥處理土壤適用於田間、苗圃營養土等。常用的消毒劑有魯恒1、魯恒2等。，可有效防治苗木病害。
2)硫磺消毒法:將硝石灰、硫磺、鋸末充分混合。硝石灰的具體用量為65，438+000公斤/公頃，硫磺為2-3公斤/公頃，鋸末為500-750公斤/公頃，將它們均勻地撒在土壤表面，用鏟子或耙子深翻混合，然後用大水充分灌溉，並用塑料薄膜覆蓋。這種方法最好在夏季使用，有利於提高土壤溫度，達到充分殺滅土壤中病蟲害的目的。
(2)物理消毒法1)太陽能消毒:方法是在溫室或田間收獲作物後，將田間老株連根拔起，多施有機肥，然後將地面翻平。7、8月份氣溫達到35℃以上時，用透明吸熱膜覆蓋，可將土壤溫度提高到50 ~ 60℃，密封在15 ~。這種方法多用於我國北方多年種植草莓、西瓜、花卉的大棚。近年來，這種方法也被用於南方設施的西瓜大棚消毒，灌溉後還能起到洗鹽的作用。
2)蒸汽熱力消毒:通過蒸汽鍋爐加熱，將蒸汽熱能通過導管送入土壤，提高土壤溫度，殺滅致病菌，從而達到防治土傳疾病的目的。這種消毒方法需要復雜的設備，只適用於經濟價值高的作物和苗床小面積應用。
3)火消毒:在敞開的苗床中，將幹木柴平鋪在床面上點燃，既能消滅表土中的病菌、害蟲和蟲卵，又能在翻耕後增加壹部分鉀肥。
此外，還有毒土法、氰氨化鈣土法、溴甲烷土法等消毒方法，可根據實際種植類型和具體栽培條件合理選擇。