經濟制度、國際政治經濟學、歐洲經濟壹體化與國際發展的比較研究。他為國際關系和MBA專業的研究生教授了十多門課程。
主要研究領域:
市場經濟體制的比較研究，特別是從中國經濟轉型、國際合作與投資、中國企業海外發展、歐洲與亞太經濟壹體化前景等角度，
主要科研工作:
近五年來，在《歐洲研究》、《德國研究》、《俄羅斯研究》、《當代世界社會主義》、《華東師範大學學報》等CSSCI核心期刊上發表學術文章20篇，發表個人學術專著2部，其中獲上海市哲學社會科學優秀成果專著類三等獎1部，主編學術專著1部，在國內外雜誌、報刊上發表綜述文章近60篇。目前承擔國家社科基金、教育部基地重大項目、上海市教委創新項目，承擔國家開發銀行委托項目4項。
社會兼職及其他:
上海國際關系學院院長，上海俄羅斯中東歐關系研究所所長，國家開發銀行特聘高級顧問。三年來，為國家相關決策部門撰寫了相當數量的決策咨詢報告，受到了國家社科基金的表彰。余南平教授在從事教學科研的同時，還擔任上海第壹財經頻道電視特約評論員、上海電視臺新聞綜合頻道特邀嘉賓、上海人民廣播電臺《公民與社會》特邀嘉賓、香港鳳凰衛視特邀嘉賓、雲南電視臺《新視野》特邀嘉賓。並在上海圖書館論壇、上海社會科學院信息發布會等論壇擔任講師，為寶鋼、中遠等大型企業提供咨詢服務。