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三亞歷史悠久，早在秦始皇時期設置的南方三郡，崖州就是其中之壹的象郡。隋設臨振郡，唐代改為振州。宋代時成為中國最南端的地級規模的州郡。因其遠離帝京、孤懸海外，自古以來三亞壹直被稱為“天涯海角”。唐代宰相韓瑗、名僧鑒真，宋代名相趙鼎、大臣胡銓和紡織家黃道婆等先後來過崖州（現崖州區），對三亞的經濟文化交流和發展作出了重要的貢獻。
2014年2月11日，國務院批復三亞市撤六鎮新設四區，分別為吉陽區（撤銷原河東管理區、吉陽鎮、亞龍灣管委會）、天涯區（撤銷原河西管理區、鳳凰鎮、天涯鎮、三亞灣管委會，育才鎮）、海棠區（撤銷原海棠灣鎮、海棠灣管委會）、崖州區（撤銷原崖城鎮）。