小鎮·客棧
李逍遙正做斬妖除魔的美夢時，被嬸母李大嬸用鏟子打醒，有客人上門還不起來幫忙。出房門招待3位苗裝客人，得到500文賞錢。李逍遙下樓後，李大嬸要他將門口要酒喝的道士趕走，但道士卻是沒酒喝就不走，正相持不下，李大嬸又讓李逍遙到廚房端酒菜到樓上給苗人首領，結果苗人首領不喝，兩個嘍羅又嫌酒淡，於是李逍遙就把桂花酒給了門口的道士。道士為了謝他贈酒之情，約他明天晚上三更到十裏坡的山神廟見面。稍後，李大嬸叫李逍遙到菜市場買新鮮的蝦。
小鎮·港口
從東南的出口走到小鎮的港口，這裏也有小鎮的菜市場、鐵匠鋪和木匠鋪。菜市場的魚販和漁夫都說這幾天風浪太大，捕不到蝦，李逍遙只好空手而回。在村口見到香蘭報知李大嬸病倒，急急忙忙地趕回客棧。
小鎮·客棧
在客棧中洪大夫說李大嬸久病不醫且疲勞過度，他也沒有醫好的把握。洪大夫走後，李逍遙在客棧門口見到苗人首領，他告訴李逍遙仙靈島水月宮可以得到治百病的仙丹，但是宮外有壹座用仙法設下的迷陣，不破去陣眼就無法進去。隨後給了李逍遙壹把破天錘，在敲破陣中的6具阿修羅神像後，自會出現壹塊發亮的石板，踩上去就會出現入宮的通道。並以防瘴氣為名，讓李逍遙吞下忘憂散。
小鎮·港口
漁夫張三為李逍遙孝心所感動，答應載他到仙靈島取仙藥。
仙靈島·迷陣
李逍遙在仙靈島的迷宮中找到6座阿修羅像，逐壹用破天錘打破後，果然出現壹塊發亮的石板，踏上去後果真出現壹條通往水月宮的通道。
仙靈島·樹林
李逍遙沿著兩旁種滿綠樹的通道進入水月宮，在西南方湖邊的大石上看到壹套女子衣衫，他好奇地驅前觀看，果有壹少女正沐浴。待少女上岸穿衣，李逍遙要她帶他進水月宮取藥，以換回衣服，少女被迫答應，但要他放下衣服向後走出十丈開外，且不許向湖邊回頭。李逍遙照此做後，卻不見少女蹤影。此時天上打雷，李逍遙以為觸犯神靈，嚇得跪地求饒，說出為嬸母求藥的經過。聽到他對神靈的祈禱，少女趙靈兒同情他的孝心，於是帶他進了水月宮。
仙靈島·水月宮
在水月宮丹房，趙靈兒給了李逍遙壹粒紫金丹。他拿了藥正要離開，在門口遇到壹老嫗，化身為蛇尾人身怪物，將李逍遙嚇暈在地，幸趙靈兒趕到，告訴姥姥事情的經過。姥姥雖不殺李逍遙，但要李逍遙選擇是娶趙靈兒為妻且永不離開仙靈島，或是留下雙手和舌頭回家。李逍遙不得已只好答應娶趙靈兒為妻。當晚在洞房，李逍遙告訴趙靈兒他必須送藥回家。趙靈兒說他可趁姥姥早上到他師父靈前上香的機會離開仙靈島。第二天分手時兩情依依，李逍遙告訴趙靈兒永不相棄，然後到海邊搭船回了小鎮。
小鎮·客棧
李逍遙將紫金丹給李大嬸服下後，忘憂散的效力正好發作，醒後將仙靈島之事忘得幹幹凈凈。晚上，他想起和道士在山神廟的約定，從床右邊的密道離開客棧，從小鎮的西南方出口，向西北行至山神廟。
山神廟
在山神廟中遇道士，他說平生不願欠人情，因此教李逍遙壹式禦劍法。李逍遙欲拜他為師，他卻乘風而去。眼見天亮，李逍遙趕回客棧。
小鎮·客棧
回到客棧，見到苗人嘍羅背壹個大麻袋進了李逍遙的房間，又不讓李逍遙進屋。李逍遙從倉庫的密道潛入房間，打開麻袋，見到趙靈兒昏迷在內，救醒趙靈兒後，得知苗人殺上仙靈島，姥姥受了重傷，她要回去救姥姥。說著說著，驚動了苗人守衛，雙方打了起來，苗人不敵逃走。
仙靈島·水月宮
李逍遙陪趙靈兒回到仙靈島，只見水月宮屍橫遍地，姥姥已剩下最後壹口氣，她說趙靈兒是苗疆黑苗族巫王之女，母親巫後十年前因遭人陷害，生死不明，趙靈兒由姥姥帶到水月宮躲藏。現在姥姥要李逍遙帶趙靈兒回苗疆探查巫後的下落，以盡人子之責。說完姥姥就駕鶴西歸了。李逍遙和趙靈兒料理完後事也乘船離開了仙靈島。
小鎮·客棧
苗人首領正在客棧中等他們回去，他們奉巫王之命要帶趙靈兒回苗疆。趙靈兒不走，與李逍遙聯手與苗人打了起來。此時李大嬸從菜市場回來，苗人首領想要挾持李大嬸，卻不知李大嬸也會武功，壹掌就將苗人首領打死。
當天晚上，李逍遙聽到趙靈兒哭聲，過去安慰她，趙靈兒要他留下，而李逍遙因服了忘憂散而忘了和靈兒在仙靈島相會之事，害怕他人議論，不敢留下。趙靈兒以為李逍遙背恩忘情，哭得更加厲害，驚醒了李大嬸，趙靈兒把心事告訴李大嬸。
第二天，李大嬸交給李逍遙壹個包袱，要他陪靈兒回苗疆尋母。李逍遙打開包袱，學會父母留下的武學冰心訣和飛龍探雲手。李逍遙和趙靈兒來到港口，搭方老板的船到蘇州。
蘇州·城外
到了蘇州城郊，南武林盟主林天南的獨生女林月如正將私奔的長工阿福和丫環銀花綁在樹上鞭打。李逍遙過去阻止林月如，兩句不合就動手較量起來，林月如不敵。李逍遙放了銀花和阿福，並把林月如綁在樹上讓她也嘗嘗被綁的滋味。走不多遠聽到林月如的呼救聲，轉回去打敗欲趁機非禮林月如的兩個小毛賊，將林月如松綁，卻被林月如用劍刺傷。林月如也嚇得逃走。為救瀕死的李逍遙，趙靈兒使出還魂咒救他壹命。
蘇州
蘇州城中正盛傳著南武林盟主林天南要為女兒林月如比武招親之事。連客棧也被林家包下，只要是參加比武招親的人皆可免費住店。李逍遙並不參加招親，就不能住在客棧裏。正要離去之際，見到3名大漢欺負文弱書生劉晉元。李逍遙為他解圍，劉晉元請二人到他房中，將床讓與趙靈兒睡，自己與李逍遙徹夜長談。
蘇州·林家堡
第二天，劉晉元壹大早就離開了客棧。李逍遙也和趙靈兒來到林家堡看熱鬧。擂臺上下熱鬧非凡，雖有不少人上臺挑戰，但都被林月如輕松打敗。林月如又將壹人踢下臺，正好壓在李逍遙身上，這壹下林月如看到李逍遙也來了。為了報昨日被綁之仇，林月如出言挑戰，李逍遙為化解仇怨，只好上臺相鬥。不料在打敗林月如後，林父出面宣布李逍遙既已獲得勝，就是林家未來的女婿，不由分說將李逍遙和趙靈兒請回家中。
林天南見李逍遙會禦劍術，誤以為他是蜀山仙劍派獨孤劍聖的弟子，雖經李逍遙解釋清楚，仍很滿意能有這麽壹位武功高強之人可繼承他武林盟主的寶座。李逍遙正要推辭，此時壹同入內的劉晉元已情急出聲，原來林劉兩家為世交，劉晉元自幼喜歡上林月如，但林月如只把劉晉元當兄長看待。此時劉晉元表明心跡，不但遭林月如拒絕，林父也因其不會武功而難以繼承家業給予婉拒。劉晉元失望中離去。李逍遙無從分辨，和趙靈兒在林家住下。晚上，趙靈兒身體不適在房內休息。李逍遙在後花園遇到月如，正想和她解釋清楚招親的誤會，婢女秋菊說林父要他們到前廳見面。原來要父找來了壹位算命先生，要給他倆合對八字。此時婢女冬梅來報，靈兒所住的西廂出現怪物，林父要管家林忠召集家人，備齊火把前去抓妖。李逍遙心系趙靈兒安危，獨自持劍入內，朦朧中只看到壹個蛇尾人身的怪物破墻而去。待月如點燈壹看，已不見趙靈兒的蹤跡。李逍遙和月如正要尾隨追查，卻為林父所阻。婢女冬梅見半人半蛇的怪物形似靈兒，林父指其為妖孽，要李逍遙與她絕裂，但李逍遙不肯從命，並立刻要從墻上的破洞離開林家去找靈兒。林月如現在已對李逍遙動了真情，不顧父親的攔阻，亦要陪李逍遙去找靈兒。林月如說，西邊有壹個隱龍窟，據說有半人地蛇的怪物藏匿其中，四處擄掠年輕女子，靈兒可能就是為該洞蛇妖所擄。
隱龍窟
李逍遙與林月如在隱龍窟的深處見到半人半蛇的男蛇妖，李逍遙令他交出靈兒，並與蛇妖打了起來。殺了蛇妖進入蛇妖洞府，救出許多被擄來當婢女的女子，卻不見靈兒的蹤影。在壹間華麗的石屋裏見到了女狐精，李逍遙將她擊斃，得到了石鑰匙。用石鑰匙打開了洞西邊的壹扇石門，將被擄來的女子送出隱龍窟。
白河村
從隱龍窟向西走，到了白河村。白河村鄰近的黑水村已經被僵屍給毀掉了，村民們擔心僵屍遲早也會侵入此地。李逍遙和林月如去拜訪村長韓神醫時，見到昏睡的趙靈兒。韓神醫說，靈兒因昏倒在野外而被救起但她現在身體還很虛弱，因此要李逍遙去找壹些藥材回來。從韓家門外的煎藥童子口中得知，目前還缺人參、雪蓮子、何首烏、銀杏子、鹿茸、活鯉魚的肝這6味藥材。月如回家去取人參、雪蓮子、何首烏，李逍遙在韓家屋後的銀杏樹可以得到杏子，再到村中漁夫家借釣具，到湖邊釣得活鯉魚。出村口見到壹名獵人，說已在路上設下捕鹿夾子，將獵人的夾子拿走，設在鹿會經過的地方，就可以抓到鹿，取得鹿茸。回到韓神醫家，林月如已經取回另三味藥，將6種藥材交與煎藥童子，煎得六神湯讓靈兒服下，趙靈兒果就痊愈。為報答韓神醫，李逍遙決定幫白河村民解決僵屍問題。韓神醫的女兒韓夢慈提到只有玉佛寺主持智修大師可以對抗屍妖，但去求救的人都沒有回來，據說都在那裏出家了，就連與韓夢慈有婚約的江少雲也壹去不回，於是3人自告奮勇去壹探究竟。
玉佛寺
白河村的守橋壯丁告訴李逍遙3人，過了橋西北方是玉佛寺，東北是黑水鎮，西南有座鬼陰山，原有山賊出沒，現在被壹群苗人所占。到了玉佛寺，見到的僧人都凈默不語，只會念阿彌佗佛，其形頗為詭異。李逍遙三人由壹名叫智澤的小和尚引見主持智修大師，想不到這個老和尚二話不說，就要將李逍遙剃發為僧。李逍遙不同意，智修大師以武力相迫，打敗這群和尚後，才知道智修和這座廟都是小和尚智澤變出來的。他是達摩法師所持的佛珠經過999年修練所幻化的。由於他看到佛經有雲“普渡眾生”，“人人皆有佛性”，以為逼人為僧即可修成正果。趙靈兒告訴他之所為實在是背道而馳。智澤深受感動，決定幫李逍遙3人消滅屍妖，將功折罪。趙靈兒要他回復原形，取名為小石頭。
小石頭說，黑水村的屍妖是來自村子北邊亂葬崗的隋朝將軍墓，其地底血池中藏有壹名赤鬼王，他控制僵屍殺人，吸取人血以修練魔功。進入將軍墓最深處，打敗將軍所化的僵屍，3人就會掉入更深處的血池，在這裏遇到赤鬼王。殺了赤鬼王後會得到土靈珠。靈兒說自古相傳，女媧聚天地之靈氣風、雷、水、火、土，煉成五顆靈珠，以鎮伏群魔。3人借助土靈珠的力量回到地面。
鬼陰山·鬼陰壇
回到白河村向村民報喜訊，卻被告知韓夢慈已被苗人帶走，並留言要靈兒單獨壹人去換她回來。於是立即趕往鬼陰山，在鬼陰山山口有兩名苗人守道，只準靈兒壹人上山，於是又是壹場戰鬥。3人突破重重關卡，終於在黑苗族設在此地的鬼陰壇中見到了負責接靈兒回苗疆的石長老。石長老說，十年前黑苗族中發生壹場劇變，巫後身亡，姥姥偷偷帶靈兒離開。而今巫王已時日不多，希望靈兒能夠回去見他壹面，並繼承王業。李逍遙不敢讓靈兒回去冒險，因此和石長老發生沖突，結果敗在石長老手下。石長老以李逍遙和林月如的生死脅迫趙靈兒隨他回苗疆。趙靈兒沒有其他選擇，只好答應。
揚州
李逍遙與林月如追蹤石長老，從鬼陰壇的石門離開，翻過了壹座山，來到揚州城外。揚州城此時正鬧女飛賊，太守下令百姓行人許入不許出。進入揚州城中，得知現任知府也不是好人，加上城中女飛賊出沒，人心惶惶。晚上客棧鄰房突然傳出抓賊的叫聲，月如沖出去，在走廊上攔住壹名身穿黑色夜行服的蒙面女子，但李逍遙趕到時已讓她逃脫，李逍遙尾隨女飛賊從客棧二樓左邊的通道出去，沿著城墻，踏著屋頂，緊追不舍，終於攔住女飛賊。女飛賊見敵不過兩人，就拋下壹個布包，跳入壹座宅院的院子裏逃走。李逍遙將布包還給鄰房遭竊的古董商，想不到布包中少了壹個紫金葫蘆，反而被古董商懷疑。隔天早上，李逍遙和林月如回到女飛賊失蹤的宅院附近查看，從三姑六婆口中得知此屋最近搬來壹位有錢的寡婦，頗為可疑。兩人前往探訪，女主人姬三娘說昨晚沒有聽到動靜，並出言勾引李逍遙，氣得月如轉身離開。李逍遙好不容易才在西邊的城墻上追上負氣的月如，見到姬三娘在井邊鬼鬼祟祟地走動。於是兩人深入井中，在壹間藏寶密室中找到了失竊的紫金葫蘆。不料官府的衙役接到密報已將井口團團圍住，將二人帶到公堂審問。太守不分青紅皂白就要用刑，林月如報出她是南武林盟主之女，當朝尚書是她的伯父，太守不敢對她用刑，卻對出身寒微的李逍遙嚴刑拷打，李逍遙只好答應太守三天內找出飛賊，以洗刷兩人的罪名。月如被扣留在衙門內充當人質，李逍遙壹人出外尋找線索。此時井口已被官府封鎖，無法進入調查。姬三娘住所已人去樓空，李逍遙在大廳神案前找到壹塊特別的方磚，踩上去在屏風後就出現壹條暗道，暗道通往井下的藏寶室，從藏寶室向井口方向調查，終於在靠近出口處找到姬三娘的藏身之處。制服了姬三娘，將她帶到公堂，她也承認了所有的罪名。月如終於重獲自由，兩人離開揚州北行。
毒蟾洞
從揚州北門走入山區，聽到路人謠傳山上出現像牛壹樣大的蛤蟆精。壹位秀才見他們身背寶劍，必有武功，願出2000文錢，請他們護送到京城，並先付壹半為定金。行至半路，遇到獨孤劍聖禦劍飛來，說他夜觀星鬥，預見今日此地會發生極大的血光之災，壹句話嚇跑了秀才，但李逍遙藝高人膽大，還是要趕在日落前下山。在半山上看到那位古董商死在路旁，身邊有布包壹個，似乎是為毒物所害。再往前行，見到壹名女子走入壹個山洞，於是入內問路。該女子告訴他們往北的棧道已被她拆了，再過幾天還要把往南的山道封起來呢，說完趕他們下山。走出山洞，月如認為她不是好人，兩人再度回去探明究竟。原來這女子是金蟾鬼母，她見二人發現她的秘密，就和蛤蟆精與二人打了起來。李逍遙打敗毒蟾鬼母後，剖開蛤蟆精的肚子，得到能避百毒的五毒珠。
野店
穿過毒蟾洞後，李逍遙二人進入路旁的小飯店，這家店是由壹群穿白衣的苗女所開的，從老板娘蓋羅嬌的口得知她們是為避人而到中原定居的。酒中含有昏睡藥，沒多久，兩人就雙雙倒下。不久蓋羅嬌就攔住稍後到達的石長老等人，蓋羅嬌要石長老交出趙靈兒，石長老不敵，使出玉石俱焚的法術赤血毒焰自爆傷敵。待李逍遙和林月如醒來後，將被震傷的蓋羅嬌救醒，得知靈兒已被獨孤劍聖帶走，不知去向。月如說她在京城有個姨媽，許久未見，要李逍遙陪她順道去看看。
京郊·小鎮
李逍遙二人來到京城郊外的小鎮上，鎮上有位水仙尊王廟，正趕上劉尚書的夫人前來上香，壹行兵丁攔住旁人，不得進入，連港邊唯壹壹艘船也被尚書夫人包了下來。正愁不得進京，尚書夫人帶著家人來到，原來她就是月如口中的雲姨，劉晉元的母親，因此壹同進京。
京城·劉宅
雲姨告訴林月如，劉晉元自從蘇州回來後就得了壹種怪病，群醫無策，現在正在後花園的廂房中療養。月如和李逍遙去探病，正看見劉晉元的病又發作了，疼得大叫。壹名彩衣美女聞聲而至，服侍他吃藥後才安靜睡著。這名彩衣女子名為彩依，是劉晉元剛娶的妻子。離開廂房時，婢女來報，夫人請兩位用餐。用餐時雲姨告訴兩人彩依嫁給劉晉元的經過。
京城·大街
飯後，林月如帶李逍遙出門逛街。到劉家對門古董商家，將布包交給古董商的妻子，得到回送的紫金葫蘆，從葫蘆的底部學到靈葫咒。在酒館中遇到在蘇州曾見過的算命仙，由於預言很靈驗，李逍遙執意贈他500百文禮金。橋頭有位乞丐，給他身上壹半錢，他會說到他曾在劉家後花園見到彩依變成蝴蝶精的事。再給100文，他會說妓院最近來了壹位小蓮兒。李逍遙疑心是靈兒，趕去調查，結果不是。回到橋頭，見劉府婢女阿萍來報，劉夫人要二人趕緊回去。
京師·劉宅
回到劉宅才知，原來是林月如的父親來了。他要李逍遙單獨和他到後花園談話，實為要試李逍遙的武功。李逍遙擋下林父的七訣劍氣後，林父就離開了。正當李逍遙和林月如在樹林前談話，看到彩依從樹林中走出，嚇了壹跳，因此再到廂房探視劉晉元，偷看到劉晉元懷疑彩依的來歷，不肯吃藥，將藥打翻。彩依不得已將劉晉元迷倒，再度出門去采藥。李逍遙將劉晉元救醒，三人出門遇到雲姨。雲姨要劉晉元暫時到她的房裏休息。此時，婢女阿香提到她家鄉如有人夢遊不醒就會找道士做法，因此雲姨給李逍遙3萬文，托兩人出外找個道士來捉妖。
京師·大街
兩人在酒館中找到壹名自稱是太乙真人門下弟子的茅山道士，索價15000文。
京師·劉宅
茅山道士看過劉晉元的病後，判斷劉晉元所中的毒是盅毒和壹種不知明的毒，常人如果中了毒都活不過7天，而劉竟活了壹個月，因此甚為奇怪，要到劉晉元房中查看。到了廂房，道士稱房中有妖氣，要作法驅妖，卻屢次失敗，嚇得逃走。月如和李逍遙壹出廂房見有異物飛過，同時飄來令人昏睡的牡丹花香，兩人緊閉呼吸，沒有昏倒，但劉府其他人等都因此而昏睡了。劉晉元也不見了。府外兵士未得劉尚書的命令也不敢入內。此時，劉府外河裏漂來壹具屍體，李逍遙將其撈起壹看，卻是傳授他劍術的酒劍仙。酒劍仙打個哈欠醒來，聽李逍遙說後要他準備開壇作法的用具蠟燭、符紙、檀香和酒。取得用具後，酒劍仙在劉府後花園施展醉仙封魔大法，結果作法沒多久就睡著了。月如以為他喝醉了，到後花園見到變回蝴蝶的彩依和昏迷不醒的劉晉元。月如不聽彩依的解釋，持劍相逼。彩依不得已將劉晉元帶到樹林裏面。
樹林
李逍遙和林月如追進樹林，見到彩依帶著劉晉元飛到壹張大蜘蛛網前，聽到她與蜘蛛的談話，才知道事情的真相。原來，壹個月前彩依不小心被困在蜘蛛網上，為劉晉元所救，但劉晉元也因此被蜘蛛精黑娘子下了纏魂絲之毒。彩依為了報恩，化身為人嫁給了劉晉元，原想用自制的百花仙釀救治他的病，結果劉晉元懷疑，拒絕用藥。如今劉晉元的病情惡化，只好帶著劉晉元來見蜘蛛精，願以己身換取劉晉元的性命。李逍遙壹看誤會了彩依，挺身與黑蜘蛛相鬥，由於黑蜘蛛壹死，此毒無人可解。彩依只好將千年道行輸送給劉晉元，以換取十年壽命，並要林月如永遠不要告訴劉晉元真相，以免他傷心。失去千年道行的彩依失去了變為人形的能力，化為壹支蝴蝶翩然而去。稍後劉夫人趕來，帶病愈的劉晉元回府。
李逍遙因靈兒之事請酒劍仙帶他去蜀山找獨孤劍聖，酒劍仙也有心收李逍遙為徒，於是施展飛仙術帶李逍遙和林月如回蜀山。
蜀山·仙劍派
到蜀山仙劍派後，酒劍仙帶二人見過師兄獨孤劍聖。李逍遙向獨孤劍聖問及靈兒之事，獨孤劍聖壹口否認。李逍遙在練丹房見到小石頭化成的玉佛珠。小石頭說，靈兒已被劍聖關到鎖妖塔中。李逍遙持玉佛珠向劍聖質問，劍聖認為靈兒是個妖孽，因此關入鎖妖塔中。由於仙劍派弟子皆不得進入鎖妖塔，因此李逍遙放棄拜酒劍仙為師的打算，酒劍仙有感於李逍遙的真誠，雖無師徒之名，卻再度向李逍遙傳授逍遙酒神咒、醉仙望月步，仙風雲體術等法術，並贈以雷靈珠，送他們到後山門。
蜀山·鎖妖塔
進入鎖妖塔，李逍遙和林月如被傳送到塔頂，從塔頂往塔底壹層壹層往下尋找靈兒的下落。兩人終於在壹層插有巨大劍柱的大廳中找到靈兒。此時李逍遙也記起仙靈島的事情，他並不介意靈兒的身分，月如也同意與靈兒***侍壹夫。這時鎮獄明王突然現身阻止，李逍遙壹看唯有武力可解決，與月如、靈兒聯手打敗了鎮獄明王。這時在第五層從壇中救出的天鬼皇帶領大群妖魔出現，要李逍遙幫忙他們離開鎖妖塔，但卻沒有有人知道離塔的方法，這時在第四層遇到的書中仙說塔底的化妖池中有7根七星蟠龍柱，是支撐鎖妖塔的，只要將柱子砍除即可，不過要小心守護柱子的神龍。由於化妖池水會融化妖魔，只有李逍遙三人可下。找得壹入水口後，3人即潛進化妖池中，陸續擊敗7只守護神龍後，將龍柱全部推倒，頓時鎖妖塔完全崩毀，而月如為救李逍遙和趙靈兒，不幸被巨石擊中。
苗疆·聖姑家
獨孤劍聖面冷心熱，亦為李逍遙的真情所感動，危急中將3人救出鎖妖塔，送到苗族長老聖姑家中治療。李逍遙只是皮肉傷，靈兒因有孕而動了胎氣，唯月如因被巨石直接打倒，已是回天乏術。李逍遙醒了之後，聖姑要他到神木林的金翅鳳凰巢中取回鳳凰蛋殼，並到大理城的火眼麒麟洞中取得麒麟角合藥，給靈兒安胎。
神木林
從聖姑家外的壹棵樹上拿到多個鼠兒果，在香蕉樹上采得香蕉2根。過了壹道橋後，來到西南方的神木林。由於鳳凰喜歡在高枝上築巢，李逍遙攀枝越樹，途中兩次遇到小猴子擋道，均用香蕉打發。最終見到鳳凰巢，趕走了護巢的鳳凰，正要取蛋，此時有壹小苗女出現把蛋搶走，追趕之際，從樹上跌下。小苗女將李逍遙救醒，得知小苗女是白苗族長的女兒阿奴。由於聖姑合藥只要蛋殼，阿奴答應他小鳳凰出生後，就將蛋殼給他，但在此之前，李逍遙需幫她到壹處隱密的樹洞是偷妖怪的寶物。
樹洞
阿奴帶著李逍遙來到壹個樹洞中，趁妖怪首領離開時進入洞中，想不到他們翻遍整個藏寶室也找不到阿奴所要的水靈珠。原來阿奴想要找到水靈珠祈雨，來化解自從巫後之變以來長達10年的旱災，化解白苗族和黑苗族之間為爭奪水源而引起的戰爭。
大理城
阿奴沒找到水靈珠，失望地離開樹洞，帶李逍遙進入大理城，伺機進入麒麟洞。大理城是白苗族首府，為了抵抗黑苗族的進攻，目前呈現劍拔弩張的警戒狀態。火眼麒麟是白苗族的聖獸，未經族長允許，兩人當然不得入內。阿奴先去找她母親白苗族長，族長正在開會商量如何對抗黑苗族，沒時間和阿奴長談。阿奴離開會議廳，正好遇見守衛麒麟洞的士兵正好抓到壹位奸細前來報告，因此心生壹計，回到麒麟洞前，騙走另壹位士兵，和李逍遙進入麒麟洞。
大理城·麒麟洞
李逍遙和阿奴在洞中找到火眼麒麟，阿奴調皮，去揪正在睡覺的火眼麒麟的胡子，醒來的火眼麒麟與李逍遙打了起來。擊敗的火眼麒麟化成人形，問李逍遙的來意，知道靈兒是女媧後裔，很大方地拔下壹支角送給李逍遙，並要李逍遙到大理城中女媧神殿走壹趟。
大理城·女媧神殿
女媧神殿是白苗族祭祀女媧女神的地方，殿中蛇尾人身石像據說是十年前大水災時帶來的，因其與女媧神形似，故在神殿裏供人祭拜。李逍遙見石像容貌與靈兒極為相似。不由得向前察看，卻被傳送到壹個地方，在此見到靈兒的母親巫後，才知石像是巫後所變。巫後問明李逍遙對靈兒的情意後，就將他傳送到十年前的南紹城。
南紹城·黑苗族王宮
李逍遙被傳送到壹處郊野，見到數名黑苗族士兵奉拜月教主之命，正在追殺正帶年僅6歲的靈兒逃離苗疆的姥姥。李逍遙殺死這些士兵，姥姥向她道謝後帶靈兒乘鳳凰離開。隨後又有另壹批黑苗士兵來到，李逍遙再次打敗這些黑苗士兵，為避免麻煩，李逍遙也換上黑苗服裝。向西走看到壹艘小船，船上的黑苗士兵要他壹起到王宮集合。南紹城此時為大水所淹，拜月教主認為是巫後所為，鼓動士兵脅迫巫王處死巫後。李逍遙潛入王宮中的監牢見到被囚禁的巫後，巫後要他到王宮地下宮殿取回天蛇杖，以便脫困。
南紹城·地下宮殿
李逍遙告訴地下宮殿石長老壹句巫王交待的暗語。進入地下宮殿取回被巫王沒收的天蛇杖，將天蛇杖交給監牢中的巫後。兩人正要逃離，巫王和拜月教主來到，拜月教主施法，使巫後露出蛇尾人身的原形，迫使巫後帶著李逍遙逃往王宮下面的地下水道。
南紹城·地下水道
在地下水道，李逍遙和巫後遇到拜月教主帶著水魔獸前來追殺。原來拜月教主破壞女媧的封印，召喚太古魔獸造成了水災，卻利用巫後不是人類而嫁禍給她。由於水魔獸遇水即生，因此只能暫時將她打敗，卻無法徹底消滅。巫後帶著李逍遙且戰且逃，終於無路可逃，最後巫後犧牲自己消滅水魔獸，而將李逍遙傳送到他家附近的山神廟。
山神廟
李逍遙被傳送到離家不遠的山神廟，見到了十年前的自己。才9歲的他說山神廟裏來了壹位受傷的老婆婆和壹位小女孩。李逍遙進去壹看，原來是姥姥和靈兒逃難至此。姥姥給他帶壹條鳳紋手絹作為信物，到港邊找接應的人。
小鎮·港口
李逍遙來到港口，壹位船上的商人認得這條鳳紋手絹，原來他就是靈月宮主所變。靈月宮主帶姥姥和靈兒回仙靈島躲藏。行前她告訴李逍遙有壹種叫做回魂仙夢的法術能夠使人在夢中看到過去，如果想要結束這個夢，只要滿足做夢之人心底的願望即可回到現實。
山神廟
李逍遙在從山神廟西南小路的樹下小箱子中見到壹顆很特別的小珠子，9歲的李逍遙過來阻止，說這顆珠子是父親送給他的，李逍遙和小時候的自己商量，以壹柄木劍交換這顆水靈珠。身上沒有木劍，可到小鎮港口處的木匠鋪裏買壹把。
大理城·女媧神殿
得到水靈珠後，李逍遙又重回女媧神殿的石像前，見到阿奴正在為他的安危禱告。原來他已失蹤壹個月了，小鳳凰也已經出生了。
苗疆·聖姑家
李逍遙將取得的鳳凰蛋殼和麒麟角交給聖姑，數月後靈兒順利生下壹個女兒，取名為憶如，以紀念月如。聖姑要李逍遙到試煉窟中抓36只傀儡蟲回來。