如今“大同模式”隨處可見，但在十幾年前，這種模式遭到了批判，遭遇了極大的危機。
耿彥博來大同之前，因為資金問題，雲岡石窟沒有得到充分保護。景區在煤礦附近，附近的高速公路上有很多運煤的重型卡車經過。空氣中含有大量的煤灰和灰塵，給石窟中的大佛披上了壹層“黑袈裟”。伴隨著空氣汙染的酸雨也在侵蝕著雲岡石窟的文物。景區附近的幾個村落長期無法拆遷，使得雲岡石窟壹度面臨失去“世界文化遺產”稱號的局面。
耿彥波克服重重困難，為雲岡石窟保護升級工程爭取到6543.8+07億元財政資金。景區附近村莊的拆遷即將完成。耿彥波組織設計了壹整套景區提升方案，隨即全面啟動景區改造。
緊接著，壹則負面新聞報道引發了全國範圍內對雲岡石窟升級改造的關註。報道的描述帶有很強的負面導向性，將景區升級與“文物破壞”和“文物造假”直接掛鉤，引起了很多文化學者和文物保護工作者對這壹項目的不滿。
耿彥波先進的設計理念不被理解，他果斷堅決的執行成為很多文物保護工作者的噩夢。批評聲不絕於耳，媒體爭相轉發報道，引起了國家文物局的重視，點名批評大同的雲岡石窟修繕工程。
國家文物局直接派工作人員到項目現場檢查，要求立即暫停項目建設，並正式提出約談通知。耿彥波親自跑到北京采訪報道，被國家文物局領導當面質問。
雲岡石窟是北魏皇家園林，全國首批重點文物保護單位，世界文化遺產，國家5A級景區。如果有人想破壞這個景區的文物，勢必會引起重點關註。雲岡石窟景區升級改造的爭議點主要有幾個:壹是建設了壹批配套建築設施，使景區的景色容易誤導遊客，“不明真相”甚至“以假亂真”，這是對歷史文物的不尊重。第二，景區的改造沒有經過專家組的充分論證。新建的人工湖可能會對石窟的墻壁、雕像和壁畫造成侵蝕破壞，造成不可挽回的毀滅性後果。三是程序不合法，未經批準就開始裝修。“先行動後行動”的高風險做法是不能容忍的。
耿彥波認真匯報了他在北京的工作，闡述了自己的想法。
第壹，中國的文物主要是民用建築。現在能看到的文物大部分都是歷朝歷代修復的，幾乎沒有沒有完全修復的古建築。只有通過修復和維護，文物才能保存更長的時間。沒有維修和保養，文物自然會隨著時間的推移而消失。
2.在雲岡石窟，新建的人工湖面積不大，只有0.8平方公裏；大同氣候幹燥。過去，空氣汙染很嚴重。酸雨、煤灰和居民生活排放物都對石窟有害。建設人工湖不僅可以美化景區環境，還可以改善景區微生態。湖與石窟之間的距離超過100米，位於東南部。而大同主要吹西北風，不能把湖水吹到石窟形成破壞。國內其他主要石窟附近幾乎都是河湖，沒有明顯的不利影響。北魏李道元在《水經註》中記載北魏石窟:“山堂水殿相對，林元錦鏡飾新眼。”說明北魏修建雲岡石窟時，附近有水。
雲岡石窟景區提升工程，從歷史風貌到科學論證，其實都經過了專家的充分研究和論證。幾十年前，石窟附近有壹條河，但近年來，隨著生態的惡化，它已經幹涸了。
第三，主要問題是未批先建，確實存在程序和法律問題。但這是因為審批流程太長，大同的重點項目太多。怕耽誤工期，著急開工。真誠表示願意接受批評，但同時希望加快專家評判和審批的進程，並希望對雲岡石窟的修繕方案提出寶貴意見。
因此，國家文物局決定對雲岡石窟進行第二次考察，並派出專家組認真研究方案，核實景區實際情況。最終，雲岡石窟修繕升級工程獲批，使雲岡石窟歷史上重現“山堂、水寺、煙寺相對”的景觀。
經過這次驚心動魄的雲岡石窟修繕，耿彥波的文物保護理念得到了宣傳，並逐漸被越來越多的專家學者認可。其中，當年采訪過耿彥博的國家文物局原局長、故宮博物院原院長、中國文物學會會長單霽翔，早已成為耿彥博的粉絲，大同市的朋友，明確肯定了耿彥博在文物保護和文化傳播方面的努力和貢獻。
2020年，大同舉辦“開明文化論壇”，單霽翔再次來到大同。他在講話中回顧了大同為保護文物所做的不懈努力和為文化發展所做的貢獻，並給予了高度評價。
另壹位文化學者是著名作家余。與歷史文化名城大同也有過多次親密接觸。2010在大同做了《大文化，大古都》的激情演講。2011年，他再次來到大同，在參觀雲岡石窟時，激動地寫下:“中國走向唐朝”。他對耿彥博的感人事跡和對中國文化發展的貢獻感到非常激動，對耿彥博壹心為民上訪的人格感到敬畏。耿彥波榮獲“2011中國文化人物”，於親自為其頒獎。
現在10年過去了，耿彥博的想法被越來越多的人理解和接受。雲岡石窟景區幾乎每年都會推出新景點、新玩法，不斷給遊客升級旅遊體驗，受到好評。
2020年5月，雲岡石窟旅遊熱被推向高潮，多所高校相繼成立“雲岡學”研究所，將世界文化遺產保護和文化研究推向新的高峰。
而壹切都離不開前人的努力，他們的思想和理念也在後人的不斷完善和實踐中進壹步閃耀。