二是海外倉建設下，企業需要負責外貿、貨物通關等諸多事宜。由於傳統目的地國家的進口貿易是由海外進口商完成的，對於海外倉的物流配送模式，這些手續都是由跨境電商來辦理。同時，在通關方式上，傳統的小包裹是通過郵政完成的，但對於海外倉的大宗發貨，大宗貨物的通關更加嚴格，認證體系更加復雜。
第三，對跨境電商的管理和服務能力要求更高。從海外倉的管理流程來看，貨物是由海外倉運營人員管理的，他們負責倉儲、物流和配送，所以需要快速、準確、實時地管理貨物，要求的信息技術水平更高。
跨境電商海外倉的發展仍面臨諸多障礙。要從各個方面發揮海外倉的優勢，逐壹解決劣勢，不斷打造海外倉模式，滿足國內外消費者良好的購物體驗。