1、保障對象不同：公租房為城市中等偏下收入住房困難家庭、新就業大學生和外來務工人員提供住房租住活動，具有臨時性和過渡性特點，解決的是“夾心層”人群的住房問題。廉租房解決的是城市最低收入或低收入住房困難家庭而建的普通租用住宅，有社會公***福利和住房社會保障性質。
2、申請條件不同：公租房：開發區、工業園區以及各用人單位利用自有土地建設的公***租賃住房主要用於單位職工，其認定標準由產權單位或用人單位提出申請，報所在地的區住房保障部門備案。非定向配租公租房主要面向中等偏下收入水平的城市戶籍家庭、新就業大學生、外來務工人員。廉租房：壹般申請人必須同時符合的條件有：具有本市城區常住戶口5年以上(符合本市軍隊轉業、退伍安置條件的人員不受此限制)的已婚家庭(含離異或喪偶的單親家庭);取得《長沙市家庭住房狀況證明的無房戶或住房困難戶;取得《長沙市住房保障家庭收入認定證明(含《長沙市低收入家庭認定證明和《長沙市城市居民最低生活保障金領取證)。