《規劃》指出，全面推進城中村有機更新，逐步消除城中村安全隱患，改善人居環境和配套服務，優化城市空間布局和結構，提升治理和保障體系，促進城中村全面轉型發展。同時，鼓勵有社會責任感和實力的大企業積極參與城中村綜合改造和綜合改造後的物業統壹管理，不以追求利潤為目的，確保城中村的可持續性。
根據規劃，綜合整治區劃劃定的土地總面積約99平方公裏。
從綜合整治分區來看，就是深圳市的城中村住宅用地，不包括已批準的更新單元規劃內的土地、土地整備規劃內的土地、棚戶區改造規劃內的土地、建設用地清理規劃內的土地和違法建築空間控制專項行動範圍內的土地。
《規劃》明確，要加強城中村租賃市場管理，具體來說，要加強城中村租賃市場監管，引導城中村存量房規模化租賃經營。
具體來說，政府相關部門要加強城中村的租賃管理，要求企業控制改造成本，並參照租賃指導價進行合理定價。改造後出租要優先滿足原租戶的租賃需求，切實保障村內低價居住空間的供應。加強市場秩序整治，嚴厲打擊城中村租賃市場違法行為，將違法信息納入信用信息共享平臺。
同時，政府有關部門要明確城中村大規模改造的要求和程序，通過規劃引導、統籌規劃、價格引導等方式，引導各區在綜合改造區劃內有序推進城中村大規模出租改造。符合條件的可納入政策性住房保障體系。政府出租後經過綜合改造的城中村住宅，納入政策性住房保障體系，統籌管理。
《計劃》指出，鼓勵多方參與全面改善。綜合考慮城中村建設現狀和經濟效益因素，通過允許就地拆建、降低更新單元規劃中合法用地比例準入門檻、設立政府專項扶持資金等方式， 要求各區政府聯合原農村集體經濟組織或鼓勵有社會責任和實力的大企業積極參與城中村綜合改造，參與綜合改造後物業的統壹管理，確保城中村的可持續發展。
同時，結合城中村現狀、空間特征和建設標準，細化通過城中村綜合改造實施的子目標和指標，明確需要消除的安全隱患和需要落實的配套設施類型。