1，兩者適用於不同的情況。
融資保函壹般是為企業尋求融資，幫助企業在銀行獲得授信額度而出具的，沒有真實固定的貿易背景。非融資擔保壹般分為投標擔保、履約擔保、預付款擔保、質量擔保和付款擔保。另外可能還有財產保全擔保和關稅擔保，有壹定的貿易背景。
2.是否有代碼。
有ISIN代碼的融資保函，無ISIN代碼的非融資保函。
融資擔保主要包括:貸款擔保、擔保擔保、融資租賃擔保、延期付款擔保、以現金償還的補償貿易擔保、信用額度擔保等。
非融資擔保主要包括:投標擔保、履約擔保、預付款擔保、海事擔保、即期付款擔保、海關擔保、訴訟擔保等。