1.負責處理租賃商鋪糾紛的部門如下:
(1)租賃糾紛也屬於合同糾紛，可以由當事人通過人民調解委員會調解解決；
(二)工商行政管理部門行政調解；
(3)可以通過仲裁解決，爭議可以提交仲裁機關；
(4)可以向人民法院提起訴訟解決爭議。
2.法律依據:《中華人民共和國民事訴訟法》第三條
人民法院受理公民、法人、其他組織以及他們之間因財產關系和人身關系提起的民事訴訟，適用本法規定。
2.店鋪租賃合同糾紛訴訟需要準備哪些材料？
1.原告和被告作為訴訟當事人資格的證明材料，包括身份證、地址信息、營業執照、組織機構代碼證等。
2.原、被告租賃合同關系的證明:租賃合同、居間人簽訂的居間合同等。；
3.租賃房屋為合法出租材料:房產證、土地使用權證、公房租賃證等。
4.原告按合同履行義務的證明材料:如租金收據、付款記錄等。
5.被告未按約定履行義務的證明材料:催告函、律師函。